本次试点的交通运输业纳税人：机构所在地在上海市行政辖区内的单位和个体工商户，以及居住地在上海市的其他个人，从事使用运输工具将货物或者旅客送达目的地，使其空间位置得到转移的业务活动，即提供陆路运输服务、水路运输服务、航空运输服务、管道运输服务的交通运输业的单位和个人，为本次增值税试点的纳税人(以下称“试点交通运业输纳税人”)，应当按照试点方案的规定缴纳增值税，不再缴纳营业税。
(一)一般纳税人和小规模纳税人的划分：试点交通运业输纳税人分为一般纳税人和小规模纳税人。年销售额超过500万元的纳税人(不含其他个人)为一般纳税人，年销售额未超过500万元的纳税人为小规模纳税人。非企业性单位、不经常提供交通运输服务的企业和个体工商户可选择按照小规模纳税人纳税。
按照国家统一的会计制度规定设置账簿，根据合法、有效凭证核算的小规模纳税人能够提供准确税务资料的，可以向主管税务机关申请一般纳税人资格认定，成为一般纳税人。年销售额未超过500万元的原公路、内河货物运输业自开票纳税人，应当申请认定为一般纳税人。
一般纳税人提供的公共交通运输服务(包括轮客渡、公交客运、轨道交通、出租车)，可以选择按照小规模纳税人的简易计税方法计算缴纳增值税，但一经选择，36个月内不得变更。
上海市原增值税一般纳税人兼有交通运输业务的，按照上述规定应当申请认定一般纳税人的，不需要重新办理一般纳税人认定手续。
除国家税务总局另有规定外，一经认定为一般纳税人后，不得转为小规模纳税人。
(二)纳税义务发生时间：交通运输业纳税人提供应税服务并收讫销售款项或者取得索取销售款项凭据的当天;先开具发票的，为开具发票的当天。
收讫销售款项，是指交通运输业纳税人提供应税服务过程中或者完成后收到款项。取得索取销售款项凭据的当天，是指书面合同确定的付款日期;未签订书面合同或者书面合同未确定付款日期的，为应税服务完成的当天。
(三)纳税地点的确定：试点交通运业输纳税人以机构所在地作为增值税纳税地点，其在异地缴纳的营业税，允许在计算缴纳增值税时抵减。非试点纳税人在试点地区从事经营活动的，继续按照现行营业税有关规定申报缴纳营业税。
(四)纳税期限：分别为1日、3日、5日、10日、15日、1个月或者1个季度。以1个季度为纳税期限的规定适用于小规模纳税人以及财政部和国家税务总局规定的其他纳税人。不能按照固定期限纳税的，可以按次纳税。以1个月或者1个季度为1个纳税期的，自期满之日起15日内申报纳税。
(五)增值税起征点：试点交通运业输纳税人增值税起征点幅度如下：按期纳税的，为月应税销售额5000-20000元(含本数)。按次纳税的，为每次(日)销售额300-500元(含本数)。个体工商户和其他个人提供交通运输服务的销售额未达到起征点的，免征增值税;达到起征点的，全额计算缴纳增值税。本起征点不适用于认定为一般纳税人的个体工商户。
(六)交通运输业营业税改征增值税后，为实现试点纳税人原享受的营业税优惠政策平稳过渡，试点期间试点交通运输业一般纳税人提供管道运输服务，对其增值税实际税负超过3%的部分实行增值税即征即退政策。
