我国的加工贸易政策规定，对加工贸易进口料件实行“保税”监管政策，即用于加工贸易出口的料件进口时，免征关税与增值税，出口时不退增值税。以加工贸易名义进口的料件，若用于生产内销产品，要补交关税与增值税。对于采用部分国内中间投入品的加工贸易出口，出口退税实行“免、抵、退”政策。应该说，这是在当前我国增值税率和关税水平较高的情况下，发挥我国比较优势充分利用国际市场的一个明智之举。正是实行了这些政策，才使我国加工贸易得到了长足发展。但是，少数不法分子受利益驱使，利用加工贸易进行走私犯罪活动。不法分子采用虚报品名、规格、数量，进口以多报少，出口以少报多，高报单耗，以次充好，甚至采用“假单证、假印章、假签名”等“三假”手段，从事走私勾当，将保税进口的货物在国内倒卖。1997年开展严打走私运动以来，连续几年破获了大量以加工贸易之名进行的走私犯罪活动。据海关统计，1997年查获30万元以上的加工贸易走私大要案401起，合计案值33.3亿元，分别占全国海关查获大要案总数的36%和总案值的54%.1999年查获加工贸易走私大要案47起，合计案值28.7亿元，分别占全国查获走私案总数的39.5%和总案值的53%(邵祥林、王玉梁、任晓薇：《未来国际贸易的主流》)，第82页，对外经济贸易大学出版社，2001年)。2000年全国海关共查获加工贸易渠道走私案件752起，案值25.4亿元，虽然案件数只占全部走私案件数的7%，但案值比例高达42%.2001年上半年，海关调查部门立案的走私案件，涉及加工贸易的案值，仍达到总案值的42.7%;海关缉私警察立案的走私案件，加工贸易的案件呈明显上升势头，共立案148起，增长48%，案值12.5亿元，增长76%，擅自倒卖保税料件、成品、甚至减免税设备是走私的主要形式。
从海关查获的走私案件看，利用加工贸易走私案占较高的比例。但是，能否据此认为加工贸易就是走私最重要的渠道呢?答案是不确定的。据国际经验，查获的走私案值，一般约为实际走私案的10%，甚至更低。在查获的走私案件中，不同方式的走私，被查获的难度不同，因此，不能简单地从已查获的走私案件中的比例，来推算不同方式在全部走私案件中的比重。加工贸易走私，由于必然在海关留下有关单据，因此，与那些“闯关”走私案相比，以加工贸易之名走私的案件，事后仍然可能查获，所以，当大规模开展打击“走私”活动时，对以往的案件，加工贸易走私更易被查获。因此，我们尚不能从近几年海关查获走私案中加工贸易走私所占的比重来推论其在全部走私渠道中的比重。也许所查获的以加工贸易方式走私金额占较高比重，只是说明这种走私更易被查获。
走私活动的猖獗，不是因为实行加工贸易政策，而是由于过高的关税和增值税造成的巨大利益的刺激，以及监管手段的落后和官员的腐败。只要上述诱发走私的原因存在，不管是否实行加工贸易政策，走私都是不可避免的。
开展打击走私活动以来，海关加强了对加工贸易进口的监管，同时，通过保证金台账“实转”等方式，试图防范加工贸易走私，取得了明显的成效。但是，也应该看到，现行的监管手段降低了通关效率，对正常的加工贸易活动，特别是交货期很短的高端产品的加工贸易活动产生了一些负面影响。这说明，沿袭这种传统的方法加强监管，成本与收益是不对称的，必须探索新的监管思路与监管方法，在提高监管效率的同时，更加方便加工贸易进出。
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