商业秘密的保护最重要的还要靠人，因此加强对涉密人员的管理至关重要。
(1)与员工签订保密协议。这不仅是保护商业秘密的最好方法之一，也往往是执法机关判断保密措施是否合理的一项重要因素，没有保密协议可能导致公司的商业秘密得不到法律的保护。可以在劳动合同加列保密条款，也可以单独签订保密协议，要求员工遵守保密义务。签订技术保密协议，应当遵循公平、合理的原则，其主要内容包括：保密的内容和范围、双方的权利和义务、保密期限、违约责任等。一般而言，员工对企业承担保密义务的内容包括：保守商业秘密的义务;正确使用商业秘密的义务;获得商业秘密职务成果及时汇报的义务;不得利用单位的商业秘密成立自己企业的义务;不得利用商业秘密为竞争企业工作的义务，等等。而且，保密协议、保密条款并不因劳动合同、劳动关系的终止而终止，在员工离职后一定期限内仍然有效。
(2)加强员工保密教育。除了签订保密协议外，企业应进一步加强对员工进行保密教育，使员工了解到企业文化、保密的范围、工作规则、违约的后果等，使员工认识到保密工作的重要性，防止在外来参观、咨询或洽谈业务中泄露。
(3)健全员工人事资料。企业应当建立健全员工人事资料，如员工的学历、专长及有无发明等资料，一方面企业可用来参考以决定分派员工担任适当的职位，另一方面，当未来和员工有商业秘密相关的争议时，也可供执法机关据以认定员工究竟有无创作能力及是否窃取公司机密等问题。另外，企业还具体告知并详细记载员工的职务范围，以避免将来在是否构成职务技术成果上造成不必要的争议。
(4)离职员工的管理。对接触过商业秘密、即将解职的员工进行离职检查，除要求其履行有关的交接手续，彻底点收员工所领借的各种物品，以便该员工所承办的各种业务能继续顺利开展外，要重申员工在离开本公司之后应继续保护商业秘密的义务，最好根据员工掌握商业秘密的具体情况，再签定一份详细、具体的保密协议，因为一般最初的保密协议，尤其是保密条款大都比较笼统。
(5)与高管人员签订竞业禁止协议。现阶段商业秘密纠纷主要表现为雇员带走雇主的商业秘密，与雇主从事竞争性生产经营的行为，为防止竞争者引诱员工跳槽，竞业禁止协议成为一个较好的选择。竞业禁止是指单位与知悉商业秘密的人员约定在解除劳动关系后一定时间内，该人员不得自己经营或在生产或经营与商业秘密信息相关竞争行业的其他单位任职，单位给予一定补偿的协议。其核心内容在于约定离职者不得利用在原单位掌握的商业秘密从事此行业的不正当竞争业务。很显然，竞业禁止协议与员工的择业自由相冲突。竞业禁止之所以被允许，是基于商业秘密保护的一个重要原则，即不可避免披露原则。员择业的一种限制，不能简单的等同于保密义务。竞业禁止期满或被认定无效，只意味受限制人员不再受择业方向限制，并不意味免除了保密义务。竞业机制协议解除后，员工仍需履行保密义务，不能泄露、使用原单位的商业秘密。
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