方案一：在保留老厂的基础上，重新注册一个新厂，新厂不申请认定为增值税一般纳税人，按小规模纳税人管理，使用普通发票。这样将原由一个厂分担的业务由两个厂来承担，即老厂生产的产品销售给需要使用增值税专用发票的单位，新厂生产的产品销售给不需要使用增值税专用发票的单位。这样处理有何好处呢？假定两个厂年销售收入均为200万元（不含税），则老厂购进货物取得专用发票抵扣进项税额为6.8万元（200×20％×17％），其他条件不变，则老厂应缴增值税为：
企业增值税税收负担率为39.2÷400＝9.8％；
方案二：老厂不变，在老厂的基础上再重新注册成立一个独立核算的经营部，注册为小规模纳税人，使用普通发票。这样将原有一个厂承担的业务划为老厂和经营部共同承担，即凡购货方需要增值税专用发票的由老厂负责销售，开具增值税专用发票，凡购货方只需要普通发票的，就由老厂先按成本价加10％毛利的价格销售给经营部，然后再由经营部按正常售价开具普通发票销售给购货方。假定该厂产品的单位正常售价为B，销售数量为A（AB＝400万元），购进原材料价格为0.2AB，购进货物取得专用发票抵扣进项税额为13.6万元（400×20％×17％），假定该厂以成本价加10％的毛利价格即0.2AB×1.1销售给经营部50％A的数量，然后由经营部按正常售价B销售给购货商，其他条件不变。那么老厂应缴的增值税为：
（200＋0.2B×1.1×0.5A）×17％－0.2AB×0.17＝（2 00＋0.11×400）×0.17－0.2×68＝27.88（万元）；
企业实际税收负担率为：35.88÷400＝8.97％；比原来少缴增值税18万元左右。
两个方案比较可以看出，方案二比方案一税负率少0.83个百分点，方案二比方案一少缴增值税3.32万元，税负轻。而且从企业角度而言，方案二比方案一更容易操作，如果考虑企业所得税，方案二比方案一优。但是，方案二涉及企业间关联交易的问题，具有一定的涉税风险。最后该厂接受了精诚税务师事务所提出的方案二。
