根据加入世贸组织的承诺，从2005年开始，我国农产品关税降至15.35%，远远低于62%的世界农产品平均关税水平，成为世界上农产品关税总水平最低的国家之一。这对国家调控农产品进出口带来很大困难。
农产品因其特有的质量不确定性，使得各国在同种商品的质量标准上难以采取相同的衡量标准。不少国家便借此发难他国，以达到抵御外国商品冲击和保护本国市场的目的。像日本、美国、欧盟对农业保护程度分别达到75%、42%和48%。一些国家还经常利用农产品的特殊性，作为与他国谈判的“筹码”，从而使原本简单的农产品贸易行为政治化。据国家有关部门透露，加入世贸组织3年多来，我国至今约有90%的农产品受到绿色壁垒的限制和影响。
据农业部调查测算，如果重点发展以农产品为原料的加工品和深加工出口，农民增收幅度一般会比初级农产品出口增值十几倍甚至几十倍。另据专家介绍，虽然美国农业直接从业人员只有几百万，但与农业相关的产业却提供了20%的就业机会，所以美国的农业预算是仅次于国防的第二大政府预算。
随着国际贸易开放的平台越来越宽广，农产品国际竞争力的强弱，已越来越体现在产品之外的贸易谈判、标准制定、预警机制等“高端竞争”能力上，而我国这方面亟需“恶补”。
——加快建立完善农业支持体系，并使之制度化、法制化、规范化。
首先是充分运用世贸组织“绿箱”政策，增加政府对农业的投入，支持农业发展。重点增加农业科技投入、农业基础设施建设投入和农村生态投入。
其次，调整和加强世贸组织“黄箱”政策支持，主要是根据世贸组织国内支持“微量允许标准”条款，对竞争性农产品建立灵敏、高效的价格支持体系。
再次，有效利用世贸组织贸易救济措施，防止进口激增对我国农业产业的冲击，并加快培养农业贸易争端解决和贸易救济措施方面的专门人才，加强农产品进口对农业影响的跟踪预警。同时，建立完善的宏观调控机制，完善农业保险制度。
山东省安丘市外贸食品公司副总经理于忠国等认为，世界发达国家基本都对农业进行保护支持，一些国家甚至对我国有“政治加价”倾向。
北京师范大学学术委员会副主任李晓西提出，我国必须以大国的心态，用系统的思路对待各种贸易谈判，要细化，不能大而化之。建立健全不同专业、不同行业的农产品出口协会，把部分政府职能分流到协会，赋予其对外谈判交涉、行业规划、价格协调等职能，及时介入许多政府不能或不便为之事，维护国内农产品生产企业和出口商的正当权益。
商务部国际贸易经济合作研究院林学贵博士介绍，近年来我国农产品出口系列技术标准建设的严重滞后，是导致我国农产品出口受阻的主要原因之一。我国农产品质量标准中只涉及62种化学污染物，而联合国食物与农业组织迄今已公布了相关限制标准共2522项，美国则多达4000多项，其他发达国家的控制标准也达数百甚至上千项。
山东省外经贸厅助理巡视员曹文等建议，国家应理顺农产品出口管理体制和质量标准体系，对像大蒜这样目前还没有国家统一标准的要尽快制定，不符合实际的标准要及时修订。国内实行的较低的控制标准应向国际标准靠拢，做到内外一致。据调查，我国标准化建设一方面空白点不少，另一方面多而乱，农业、质检、外经贸、环保等部门都有本系统的标准和认证，而一些企业则抱怨无所适从。(责任编辑：user2)
----探索使用期货、拍卖等现代交易方式和手段，实现国际大流通，在农产品国际定价过程中争得发言权。
目前我国农产品出口基本上是一般贸易和加工贸易，做的是低端生意。我国应积极发展期货、拍卖等交易方式，适当放开期货投资者准入限制，培养一定数量的机构投资者;同时扩大期货市场的品种数目。我国已成为世界最大的皮毛业贸易国及深加工国，但交易中心却在芬兰、丹麦，其拍卖会40%的皮张销售给了我国。
我国目前农产品出口基本还处于对国外市场跟进、应付阶段。目前，我国已初步建立起中央、地方、行业协会和企业四位一体的预警体系和机制，但部门之间、上下之间、企业之间信息畅通共享方面，做得还很不够。专家建议，我国应尽快建立有效的国际农产品信息发布机制。政府跟踪搜集、分析并及时发布国际农产品生产、需求动态和主要贸易伙伴国的政策动态。在中央和有关省(市、区)设立农产品出口机构，建立农产品外经贸信息与咨询服务体系和信息发布机制。
同时，建立农产品进出口预警和防御机制。参照世界贸易组织中“特殊保障措施”的数量触发和价格触发的原理，分别从进出口数量和价格变化两个方面确定临界点，只要达到两个标准中任一标准，就发出预警信息并立即采取防御措施。同时，注意研究和制定反非关税壁垒措施，加强对贸易交往国进口产品的监控检验，当对方国贸然提出阻碍我出口农产品的非关税措施时，应当有相应的反出口阻碍措施。
----进一步提高新产品的研究开发能力和终端市场销售能力。
山东省外经贸厅助理巡视员曹文说，我国不少企业虽然日益重视开发精深加工产品，但基本上还是在适应国际市场，远远谈不上引导和培养市场。肯德基、麦当劳能做到世界500强，相比之下我们对食品的研究太不够了。
应该看到，越来越高的全球农业对外开放程度是把“双刃剑”，不只是我国面临世界农业市场的竞争，种种不利障碍也同样冲击着他国。我国只有早作准备并及时转变农业发展模式，才能真正应对突如其来的新变化，进一步融入经济全球化进程，并在激烈的国际农产品贸易竞争中占据自己应有的份额。
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