(1)承租人不履行合同，拖欠租金纠纷。这类纠纷是目前房屋租赁纠纷的主要表现形式。企业和个人租赁房屋进行生产、经营、办公，因经济效益发生负增长，随之发生的就是欠租金和因欠租金的大量房屋租赁纠纷;个别住宅出租屋也存在这个情况。出现拖欠租金纠纷后大致会出现三种处理方法：①租赁双方协商一致，要么承租人及时付清租金，要么出租人同意延期支付，不涉及租赁合同的其他方面。②在解决拖欠租金问题的同时，租赁双方还就由此产生的违约责任问题一并解决，继续履行租赁合同。③解除租赁合同。对已失去继续履行合同基础的租赁关系，或由双方协商解除合同，或由一方起诉而终止。
(2)不签订书面合同，或合同不规范，主要内容不完备，双方权利义务不明确而发生租赁纠纷。由于租住双方缺乏法律知识，或怕麻烦、图简便，特别是农村股份公司村民出租房屋时，很少签订书面合同，更是留下了纠纷的种子。
(3)损害赔偿纠纷。房屋租赁关系中的损害赔偿纠纷同其他法律关系中的损害赔偿一样，主要是由侵权行为引起的，常见的有房屋损坏赔偿、人身或财物损害赔偿、侵犯房屋共有人合法权益赔偿、承租人擅自对房屋所作的装修如何赔偿等。从司法实践看，目前颇有争议的是租赁关系结束后，承租人对房屋所作的装修如何赔偿。
(4)房屋租赁期间出售的优先权纠纷。在房屋租赁期间，出租人可以出售房屋，但根据我国合同法规定，在相同条件下，承租人有优先购买该房产的权利。出租人在出售房屋之前应按规定时间(深圳市规定应提前一个月)书面通知承租人。
(5)转租纠纷。这属于出租人没有租赁权而出租房屋，房屋的所有权人不予以追认而发生的纠纷。按规定，承租人转租房屋时应得到出租人的同意，否则出租人有权解除租赁合同。
(6)未经有关部门批准，擅自改变房屋使用功能而发生的纠纷。房屋的用途是由房地产主管部门规定的，利用出租屋从事旅馆、餐饮、娱乐、网吧等经营性活动必须符合有关规定。近年来，未经有关部门批准，擅自改变房屋使用功能而发生的纠纷在房屋租赁纠纷中为数不少。如八卦岭、上步、车公庙等工业区，原房屋使用功能绝大多数是厂房，但现在实际上绝大部分已改变为商业用途。其中未经审批业主或承租人擅自改变用途的占有相当大的比例。这类房屋进入租赁市场后，极易发生租赁纠纷。又如，承租人出租屋用来经营旅馆，但出租人所出租的房屋事实上不允许用来经营旅馆，而出租人未履行告知的义务，导致被有关机关采取强制措施而无法经营，发生纠纷。
(7)为逃避管理和偷逃税费而变相出租房屋发生的租赁纠纷。一些业主为了不交租赁税费，便和承租人串通，假以合作、联营、承包甚至借住的名义变相出租房屋，结果有的承租人假戏真做，不但不交房租，反而要出租人承担相应的经营责任风险，从而导致双方发生租赁纠纷。由于当事人规避管理，发生纠纷后，往往因其行为的违法性致使合同无效，而得不到法律的有效保护。
(8)专业市场欠租金的租户联手拒交租金而发生租赁纠纷。一些经营亏本或获利较少的承租人，为了堤内损失堤外补，即少交或不交租金，联络多个小业主(承租人)以各种借口拒交租金，进而转移其经营风险。而且如果出租人处理方法欠妥或所出租的房屋在产权、质量、用途等方面存在瑕疵的话，就极易发生多米诺骨牌效应，引起市场所有承租人拒交租金甚至索赔损失的事件发生。
(9)出租人提前终止合同引起的纠纷。租赁期限未满，出租人提出种种借口，提前终止合同的履行，要求承租人腾出出租房屋而发生的纠纷。这种情况在无限期合同中也经常出现。
