指数基金的投资管理过程主要包括构建指数基金初始证券组合、现金红利再投资、证券权重调整及基金绩效监控等。
1、构建初始证券组合。在确定了所追踪的市场指数之后，基金管理人将根据所采取的追踪指数方法在市场上买入证券，构建基金初始证券组合。
2、现金红利收入再投资。一旦初始头寸建立之后，基金经理的一项主要工作就是对基金收到上市公司派发的现金红利及时进行再投资。从理论上讲，基金经理应该每天把收到的现金红利按比例分配到指数中每一只证券上，但是，这种做法的成本太高，现实的做法是每隔一段时间，比如一个月，定期将收到的现金红利(及其它现金收入，例如，开放式基金从新股东收到的现金)进行再投资。
3、证券权重调整。一旦追踪市场指数中的证券权重发生变化时，指数基金也必须及时作相应的调整，以保证基金与指数的一致性。大多数市场指数都会定期进行调整，把一些不再符合入选指数标准的证券剔除，而代之以其它更符合标准的证券。此外，即使那些没有调整的股票，其权重也可能发生变化，例如，某家上市公司可能配售新股，另外一些公司可能回购部分股份。一般而言，成熟资本市场中这些变化并不十分频繁，但在新兴资本市场中，这些变化是十分频繁的，因此指数基金所作的相应的调整工作是必须加以重视的。
4、为保持指数基金的投资绩效与所追踪的市场指数相一致，基金经理需定期对基金追踪市场指数的准确度进行评估。一般来说，没有哪个基金的表现会与其追踪的市场指数完全一致，交易成本、零散股票数量买入的限制(买入股票数量必须是100股的整数倍)等多种原因都会引起指数基金的业绩相对于市场指数表现出一定的偏差。基金管理人要监视这种偏差，确保这种偏差稳定地保持在一定的范围之内。如果出现不正常的偏差，基金经理应分析问题之所在，并采取相应的措施。
在大多数情况下，指数基金投入运行以后，主要工作就是上述过程的不断重复，以确保指数基金与市场指数相一致。标准的指数基金不主张对市场指数的运行方向进行预测，因而总是长期持有市场指数的证券组合，获取与指数相当的投资收益。
