（一）首次引入“居民企业”和“非居民企业”概念 国际上大多数国家对个人以外的组织或实体课税，是以法人作为标准认定纳税人的。实行法人税制是企业所得税制发展的方向，也是企业所得税改革的内在要求，有利于更加规范、科学、合理地确定企业的纳税义务。按照国际的通行做法，新企业所得税法在界定纳税人身份时采用了规范的“居民企业”和“非居民企业”概念，以法人主体为标准纳税。居民企业要承担全面纳税义务，就其境内外全部所得纳税，而非居民企业则承担有限纳税义务，一般只就其来源于我国境内的所得纳税。
（二）收入总额的口径有变化 旧企业所得税法对收入总额的规定是纳税人在一个纳税年度内取得的各项收入，包括生产、经营收入、财产转让收入、利息收入、租赁收入、特许权使用费收入、股息收入和其他收入，采用的是列举法；而新企业所得税法则采用宽口径的收入总额概念，将企业以货币形式和非货币形式从各种来源取得的收入作为收入总额，然后剔除如财政拨款、依法收取并纳入财政管理的行政事业性收费、政府性基金等，从而新企业所得税法的收入总额口径比原来要大，虽然实际计算结果没有太大的差异，但新规定有利于税务部门掌握企业所有的收入来源，从而避免企业漏记收入。
（三）“两税合并” 新企业所得税法最大的变化就是将内外资企业所得税率统一为25%.旧企业所得法下内资企业和外资企业的所得税税率均为33%，但对设在经济特区的外商投资企业、在经济特区设立机构、场所从事生产、经营的外国企业和设在经济技术开发区的生产性外商投资企业等减按15%的税率征收企业所得税；对设在沿海经济开放区和经济特区、经济技术开发区所在城市的老市区的生产性外商投资企业减按24%的税率征收企业所得税；对企业年度应纳税所得额在3万元至10万元和3万元以下的分别实行27%和18%的优惠税率，从而内资企业平均实际税负为25%左右，外资企业平均实际税负为15%左右。同时，旧企业所得法税率档次多，使不同类型企业的名义税率和实际税负差距较大，因此，有必要统一内资、外资企业所得税税率。另外，新企业所得税法规定居民企业的所得税税率为25%，非居民企业的所得税税率为20%.符合条件的小型微利企业，减按20%的税率征收企业所得税；国家需要重点扶持的高新技术企业，减按15％的税率征收企业所得税。新企业所得税法实施后，内外资企业的税负趋于公平，可以避免“假外资”企业造成的国家税源流失现象。
（四）准予扣除的项目不同 首先，对于工资支出，旧企业所得税法下，内资企业原只能按照计税工资扣除，而外资企业则可以据实扣除。新企业所得税法规定，企业均可以按照工资的实际支出据实扣除，从而缩小了内外资企业的差距，但新企业所得税法同时也规定，工资支出应做到真实、合理，否则税务机关有权调整工资扣除数。其次，旧企业所得税法对于公益性捐赠只允许在年度应纳税所得额的3%范围内扣除，超过部分不得扣除，这不仅使计算扣除限额时比较繁琐，而且企业多捐赠却未必能少纳税，无疑抑制了企业参与公益性捐赠的积极性。新企业所得税法将公益性捐赠的扣除限额放宽为年会计利润的12%，不仅使计算简便，而且使企业捐赠公益事业越多，获得的税收优惠也越多，无疑会提高企业捐赠公益事业的积极性。再次，旧税法规定广告费用可以在当年全部扣除，新企业所得税法则规定企业实际支出的广告费用按照年度销售额的一定比例作为当年扣除限额，未能在当年全部扣除的可以在以后年度继续扣除。
（五）税收优惠政策有改变 新税法统一了税收优惠政策，保留了对中西部地区的税收优惠，并将税收优惠原则由以区域优惠为主的格局，转为以产业优惠为主、区域优惠为辅、兼顾社会进步的新的税收优惠格局，同时用间接优惠替代直接优惠，将税收优惠政策与具体项目挂钩，将优惠政策落到实处。具体而言：第一，扩大。新企业所得税法放宽了地域限制，规定“国家需要重点扶持的高新技术企业，减按15％的税率征收企业所得税”，同时严格了高新技术企业的认定标准，确保真正的高新技术企业享受到税收优惠政策；新企业所得税法扩大了对环保的优惠政策，规定“企业购置用于环境保护、节能节水、安全生产等专用设备的投资额，可以按一定比例实行税额抵免”；对于创业投资企业，新税法规定“创业投资企业从事国家需要重点扶持和鼓励的创业投资，可以按投资额的一定比例抵扣应纳税所得额”，其投资额的可抵扣比例达到70%，优惠力度相当大。第二，替代。（1）现行税法对于安置待业人员和残疾人员达到一定比例的企业直接享受免征或者减征企业所得税的优惠政策，新税法用替代性优惠政策代替直接减免税优惠政策，对于安置残疾人员及国家鼓励安置的其他就业人员所支付的工资可以在计算应纳税所得额时加计扣除，这样既给予了企业优惠政策，又保障了待业人员和残疾人员的权益；（2）新税法改变了对利用“三废”为原料生产的企业直接免征或减征企业所得税的方式，取而代之为对企业综合利用资源，生产符合国家产业政策规定的产品所取得的收入可以在计算应纳税所得额时减计收入。第三，取消。取消了对经济特区、上海浦东新区和经济技术开发区以及产品出口外商企业、生产性外资企业，免征、减半征收或定期减免所得税的税收优惠政策，同时清理取消了地方性的所得税税收优惠政策，规范了税收优惠政策体系。第四，过渡。对按照现行税法享受低税率和定期减免税优惠政策的老企业，给予5年的过渡性照顾期，逐步过渡到新税率，可以减少新税法对企业的冲击，实现平稳过渡。
（六）增加了反避税条款 面对企业日益增强的避税现象，新企业所得税法借鉴国际惯例，对关联方转让定价作了明确规定，增加了一般反避税、防范资本弱化、防范避税地避税、核定程序等反避税条款。
（一）预提所得税的筹划 对股息征税是很多国家的普遍做法。而我国对外资企业的股息免征所得税，这也是导致出现日益严重的“假外资”现象及税源大量流失的重要原因。新企业所得税法对非居民企业取得的股息、红利开征所得税，税率为20%，这对部分借国外低税区来华投资的企业有较大影响。这部分非居民纳税人可以利用我国和其他国家或地区的税收协定合理避税。如目前我国香港、爱尔兰、毛里求斯、巴巴多斯等国家和地区，与我国的税收协定均约定对股息适用不超过5％的预提所得税税率，美国、加拿大等国与我国签订的税收协议对股息适用不超过10%的预提所得税税率。非居民企业可以将公司注册地迁往上述国家或地区，从而规避部分税收。这是一种着眼于长远的避税方法。另一种短期避税方法是尽快将已有的股息汇出境外，或者在新企业所得税法生效前进行股息再投资，不仅可避免20%的所得税，还可以享受原外商投资资企业再投资退税优惠政策。
（二）企业形式的筹划 新企业所得税法规定，在我国境内设立不具备法人资格营业机构的居民企业，应当汇总纳税。这意味着总分支机构要合并纳税，而母子公司则是分别纳税，那么已经设立在经济特区、上海浦东新区、经济技术开发区以及享受税收优惠政策的中西部地区的企业以及享受低税率的其他企业，在其他地区应设置分支机构，而不要选择设立独立核算的子公司。因为，对于这类企业新企业所得税法给予5年的过渡期，现有企业可以充分利用这项规定，将适用高税率的分支机构并入适用低税率的总机构纳税。总分支机构汇总纳税，还可以互相弥补亏损，从而减轻企业的税收负担。
（三）企业类型的筹划 新企业所得税法对小型微利企业实行20%的所得税税率，高新技术企业实行15%的税率，但创业投资企业享受一定的税收优惠政策，因此，要充分利用企业类型进行税务筹划，如处于小型微利企业临界点的企业应尽量往小型微利企业界定标准靠拢，以适用20%的低税率；对于现有将高新技术仅作为部门核算的公司，应将高新技术业务剥离出来，成立独立的高新技术企业，以适用15%的税率。另外，应尽量设立创业投资企业，以享受70%投资款抵免应纳税所得额的优惠政策。
（四）其他筹划 新企业所得税法规定“本法公布前已经批准设立的企业，依照当时的税收法律、行政法规规定，享受低税率优惠的，按照国务院规定，可以在本法施行后5年内，逐步过渡到本法规定的税率”：“法律设置的发展对外经济合作和技术交流的特定地区内，以及国务院已规定执行上述地区特殊政策的地区内新设立的国家需要重点扶持的高新技术企业，可以享受过渡性税收优惠”，而对于在新企业所得税法公布后批准设立的企业则依照新企业所得税法执行25%的税率。那么近期准备设立企业的投资者可以“借壳”避税，这就是借用已设立在低税率地区实际只是有少量业务或者干脆没有业务的休眠企业的壳资源从事新业务，从而享受过渡期税收优惠政策。当然，这种做法要具有一定的风险，更适集团公司利用下属休眠企业开设新业务。
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