牛根生以出让蒙牛乳业控股权的代价，换来蒙牛的解困。今年7月初，中粮集团联合私募股权基金厚朴投资公司通过设立特殊目的公司(中粮集团持股70，余下的30股权由厚朴投资持有)，以每股17.6港元认购蒙牛乳业发行的1.738亿股新股，并从蒙牛原股东处共计购得约相当于公司摊薄后的10股份。交易完成后，该特殊目的公司将持有蒙牛乳业合计3.476亿股，约占本20.03。中粮与厚朴投资以61亿港元代价，成为蒙牛乳业的第一大股东。
中粮入主后，为打消投资者和经营管理层的顾虑，曾以“长期持股的战略投资者”表示自己的身份。中粮也承诺入股后，不参与蒙牛的具体经营管理，不改变现有经营团队的连续性和稳定性，也不改变目前的战略方向。
但资本对决策权的渴望是一般规律。“宁高宁从华润到中粮，一般没有当家不做主的时候，进入蒙牛也一样。”熟悉中粮作风的行业分析师称。中粮入主后，在蒙牛的董事会中11名董事占3个名额，分别是中粮集团董事长宁高宁、总裁于旭波以及中粮战略部总监马建平，但由于三位均为非执行董事，因此在上市公司核心业务上的话语权变得非常重要。对于牛根生辞任和中粮于旭波掌帅，中粮集团有关人士接受采访时表示：“这是蒙牛的事情，中粮对此不作评论。”
中粮的进与牛根生的退，在时间上似乎表现得非常默契。虽然一场巨大的三聚氰胺风暴改变了牛根生在2008年50岁退休的愿望。但随着中粮入主后，蒙牛的资金状况也正逐步好转，去年年报显示公司2008年全年市场销售已恢复九成。蒙牛重上轨道令牛根生重新筹划从蒙牛抽身而退。“牛根生虽然辞任后，仍然担任内蒙蒙牛董事一职，并出任蒙牛乳业安排的新职位董事会主席，但实际上牛根生已经退出一线。未来，内蒙蒙牛将由董事长于旭波掌控业务经营管理，而上市公司蒙牛乳业方面，原执行董事杨文俊转任公司总裁。中粮入主后，中粮宁高宁及焦树阁分别担任董事会副主席。”熟悉蒙牛乳业的证券分析师称。
对于牛根生的淡出，蒙牛副总裁兼新闻发言人姚海涛对记者表示，“并不一定是退休”，姚海涛表示内蒙蒙牛是上市公司控股的企业，而牛根生在上市公司仍担任重要职位。而据了解，牛根生目前仍拥有蒙牛乳业263533393股权益。
“牛根生退出董事长的位置，或再投身现代牧业，是个不错的新选择。”江智慧向记者称。中国乳业的这次三聚氰胺危机，源于国内乳业市场发展与牧场建设管理水平不协调，牛根生淡出蒙牛，其创办的老牛基金会参股的现代牧业有可能成为牛根生奋斗的一个全新战场。
据了解，目前现代牧业的主要股东有KR、老牛慈善基金、蒙牛集团等。其中老牛慈善基金，是由蒙牛创始人牛根生在2004年12月在呼和浩特注册成立，该基金最初主要用于员工福利，后来，随着发展，资金逐渐转移到教育、医疗、扶贫等方面。2007年底，“老牛基金会”投建了“老牛投资”，这是一家主要投资农业等领域的基金，该机构目前最大一次投资就是重组现代牧业。
现代牧业除了向蒙牛集团提供原奶，现代牧业与蒙牛的特殊渊源，其也不避讳，曾公开称公司创办人为蒙牛集团前高级管理人员。外界传现代牧业董事长邓九强曾任蒙牛集团副董事长。据了解，位于安徽马鞍山的现代牧业2005年成立，截至目前已在全国安徽、山东、张家口、内蒙古、四川等地建立7个成万头规模的奶牛牧场，而目前在建的牧场还有4个。
主业为奶牛养殖、为品牌乳制品企业供应原奶的现代牧业，现成为中国最大的奶牛业公司，原奶的总生产能力超过15万吨/年，公司未来的目标是在未来几年中再构建20至30家大型农场。现代牧业因此吸引了国外基金对中国农业上游资源投资的极大兴趣，目前已经取得包括美国私募股权基金公司KR在内的2亿美元左右的股权投资。据称，KRR在现代牧业中占20左右的股份。
“中国有一家主营牧场的公司在美国纳斯达克上市，其业务类型与现代牧业非常相似。目前该公司的盈利率比蒙牛乳业还要高，因此相信牛根生未来有可能会对现代牧业倾注更多的精力，再谋划将其打包上市，从这个角度看，牛根生的新选择也是个新的机遇。”江智慧向记者称。“不过，牛根生作为蒙牛乳业的灵魂人物，离开有可能动摇内部核心管理层的工作信心，从而对上市公司有一定影响。”
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