向反法同盟申请停战失败后，执行了稳住普鲁士中立地位，争取俄国退出反法同盟，权利摧毁奥军，集中力量打击英国的政策。
当时梅拉斯统帅的驻意奥军将马塞纳将军围在热那亚，拿破仑派莫罗将军前往莱茵线与奥军作战，自己则越过阿尔卑斯山从后被偷袭了梅拉斯将军，利用炮兵和骑兵的优势取得了决定性胜利，莫罗将军也胜利，奥法签订了《吕内维尔合约》，宣告着第二次反法同盟的解体。
俄国退出了同盟，普鲁士保持了中立，而且由于英国在海上实行封锁政策损害了他们的商业利益，以致他们同瑞典，丹麦组成了商业同盟。
此时法国已经准备好与英国作战，而英国由于国际的孤立地位，国内农业歉收和爱尔兰问题导致皮特辞职，阿丁顿上台，签订了《亚眠合约》以大大有利于法国的内容使波拿巴赢得了光荣的和平。
拿破仑令人眩目的成就掩盖了他对恣意妄为，为他的个人野心提供了方便，1802年4月，立法院，保民院改选借此机会清洗了20多位反对派，在军队中也进行了清洗，包括莫罗将军。
经过清洗的立法机构对拿破仑表现更为顺从，任命波拿巴为10年执政，建立了向波拿巴效忠的“荣誉军团”
之后波拿巴暗示全民公投决定他是否担任终身执政，赞成330万，反对8000，为了适应这一变化元老院通过了共和十年宪法，第一执政有权利缔结条约，任命第二执政和第三执政，有权向元老院制定自己的继承人，增强了元老院的权利，削弱了保民院和立法院。
拿破仑虽然取得了如此多的成就，却十分重视法制建设，1800年8月设立了民法典起草委员会，1804年3月1日通过《法国民法典》即《拿破仑法典》宣布保护私有制度，公民法律上一律平等，保护资本主义生产关系的契约，带有明显的封建家长制和男权色彩，是一部典型的自产阶级社会的法典
