首先，劳务分包企业“空壳化”倾向日趋严重，难以形成稳定的、高素质的新型建筑业产业工人队伍。
建筑施工企业实行管理层和作业层相分离的体制改革后，劳务企业和劳务队便成了施工生产一线的主力军。尽管国家以及各级政府先后出台了一些相关政策，鼓励和扶持劳务分包企业这一新生事物的发展，但是由于体制、环境、政策及劳务企业自身存在的种种原因，劳务企业不仅没有实质性地发展起来，而且出现了萎缩的趋势，多数劳务企业缺乏相应的企业管理和技术人才，更不注重对农民工的培训、安全教育和管理。据部分省市的统计，有些地区劳务分包企业的“空壳化”比例高达62%以上。这类劳务企业只有少数几个管理人员，承接到劳务分包任务后，临时拼凑农民工队伍，而大多数农民工缺乏组织、受教育程度较低、未经职业培训就进入建筑行业，职业技能和整体素质不高，难以保证建设工程质量和施工安全。
在许多地区，劳务层基本为“包工头”形式的作业队、短期合同用工、派遣工等临时性务工人员，尤其是“包工头”形式的劳务用工方式一直存在，造成了建筑劳务市场的无序竞争，出现了一批“有资质、无队伍”、“有企业、无管理”的劳务企业，管理责任无法有效落实，导致违法分包、挂靠、恶意讨薪行为屡屡发生，拖欠农民工工资隐患依然存在。
还有许多劳务企业法纪观念淡薄、缺乏责任感，一旦出问题就向总承包方、业主和政府部门推卸责任，自己逃之夭夭。过后又重新注册，改头换面进入建筑劳务市场。此外，也存在部分劳务企业涉黑现象，以讨要农民工工资为借口，组织社会闲杂人员、甚至与黑恶势力、高利贷公司相勾结，非法、暴力逼迫总承包企业、业主、政府部门就范。
劳务人员质量安全意识和职业技能水平有待提高。多数农民工是在找不到其他合适工作岗位的情况下进入建筑行业的，丢了镰刀拿起瓦刀，没有经过必要的从业常识和职业技能培训，安全质量意识淡薄。同时由于劳务人员流动性较大，大部分总承包和专业承包企业不愿意承担对劳务人员的技能培训，多数劳务企业也没有实力对劳务人员进行技能培训，导致高水平的技术工人匮乏，工程质量受到影响，存在安全生产事故隐患。大部分劳务企业，注册资本金规模小，抵御所面临风险的能力不足，且由于人工费定额标准与市场实际工资差距较大，人工成本越来越高，劳务分包企业利润越来越低，难以负担从业人员的各项保险、技能培训以及各项税费，进而留不住技术能力强的和复合性人才，稳定的产业工人队伍无法形成，企业难以成长壮大。
其次，劳务队伍的选择难以规范，施工过程监管难以到位。
随着建筑施工企业由劳动密集型向技术、管理密集型转化，工程项目管理模式也发生了变化。项目经理的利益与项目的盈利状况紧密相连，项目经理的自主权加大，项目经理在选择劳务队伍时往往侧重于报价的高低，致使劳务公司难以与个体包工头竞争，劳务挂靠、层层分包现象屡禁不止。在选择劳务队伍时，招标程序难以规范。有的业主或地方官员，以各种方式干预劳务分包招标活动。这样，劳务队伍的招标成为走过场的幌子，难以保证劳务队伍的业务技能水平，更有甚者，劳务分包人依仗与业主、政府官员的关系，在施工过程中不服从总包方的管理，协调难度大，使总包方十分被动。
通常建筑施工总承包企业都有一套系统完整的工程项目管理制度和管理体系，然而实行劳务分包以后，这些管理制度和相应措施往往只能贯彻到劳务队，而不能很好地落实于劳务人员。特别是质量管理体系、安全管理体系、技术操作规程、企业管理制度等很难纵深渗透到每一个操作岗位，技术交底流于形式，施工日志缺失，安全管理不善，材料浪费严重。
