1、所得税率优惠。高新技术企业享受15％的优惠所得税率，相当于在原来25％的基础上降低了40％。
2、“两免三减半”（取消）。原深圳特区以内，2008年1月1日以后成立的企业自取得第一笔生产经营收入所属纳税年度起，第一年至第二年免征企业所得税，第三年至第五年按照25％的法定税率减半征收企业所得税。
3、人才安居奖励补贴。高新技术企业可以推荐一位本公司的高层次人才申请奖励补贴。因城市的不同而不同，以深圳市为例子：补贴标准为：龙华新区240万（50％配套），宝安区320Ｗ（100％配套），光明区240万（50％配套），福田区170万（10万），龙岗区240万（50％配套），其他区域均160Ｗ。
4、高新技术企业符合条件的技术转让所得免征、减征企业所得税。一个纳税年度内，居民企业技术转让所得不超过500万元的部分，免征企业所得税；超过500万元的部分，减半征收企业所得税。
5、高新技术企业固定资产加速折旧。允许加速折旧的固定资产包括：由于技术进步，产品更新换代较快的固定资产；常年处于强震动、高腐蚀状态的固定资产。采取缩短折旧年限方法的，最低折旧年限不得低于本条例第六十条规定折旧年限的60％；采取加速折旧方法的，可以采取双倍余额递减法或者年数总和法。
6、研发费用加计扣除。企业为开发新技术、新产品、新工艺发生的研究开发费用，未形成无形资产计入当期损益的，在按照规定据实扣除的基础上，按照企业研究开发费用的75％加计扣除；形成无形资产的，按照无形资产成本的175％摊销。
7、进入高新区股份代办系统进行股份报价转让的高新技术企业，予以最高180万元资助。
8、高新企业认定是新三板上市的必备条件，优先批准符合上市条件的股份制高新技术企业股票上市。
9、高新技术企业认定是申请各级相关政府资金的必备条件之一。
10、高新技术企业可优先获得办公及工业用地的获批。
11、高新技术企业认定将有效地提高企业的科技研发管理水平，重视科技研发，提高企业核心竞争力，能为企业在市场竞争中提供有力的资质，极大地提升企业品牌形象，无论是广告宣传还是产品招投标工程，都将有非常大的帮助。
12、高新技术企业对于任何企业都是一个难得的国家级的资质认证，对依靠科技立身的企业更是不可或缺的硬招牌，其品牌影响力仅次于中国名牌产品、中国驰名商标、国家免检产品。
