但与四五年前的一哄而上相比，现在的生物柴油行业即使免征消费税，也难立即“咸鱼翻生”。山东一家生物柴油厂商代表说：“这个行业已"名存实亡"，很多工厂虽然还在生产脂肪酸甲酯（生物柴油的主要成分），可真正用作生物柴油的很少，绝大部分都用作塑料添加剂了。”
生物柴油为何处境窘迫？要从其发展最初说起，第一代生物柴油主要原料为餐饮废弃油脂和酸化油。5年前，当时的废油脂价格处于低位。在新能源热潮和欧美生物柴油行业的示范作用下，大量民营资本涌入生物柴油行业，整个行业的产能从几近于零迅速膨胀到200多万吨的规模。
但到2007年，随着国际原油价格一路攀升，整个油脂行业的价格随之大涨，原料价格高企成为最大的问题。
这个问题至今没有解决。上述山东企业代表称：“地沟油成本近5000元/吨，加上1000多元的加工成本，再加上1000元左右的其他费用，总成本就近7000元/吨。普通0#柴油批发价为7600元/吨左右，生物柴油目前即使找到买家，也只能低价出售，价格要低600元/吨。根本就是卖一吨亏一吨。”
一度被寄予厚望的木本植物，其实并没有成为生物柴油主力原料。因为生物柴油盈利前景不明朗，且受亩产量、采摘、养护成本等因素制约，中石油、中石化在西南的木本原料生物柴油项目至今未大范围展开。
在税收方面，国家曾对生物柴油进行过一定扶持。2006年12月国税总局《关于生物柴油征收消费税问题的批复》（下称《批复》）中就曾指出，以动植物油为原料，经提纯、精炼、合成等工艺生产的生物柴油，不属于消费税征税范围。但两年后《国务院关于实施成品油价格和税费改革的通知》中废除了《批复》的优惠政策，确定生物柴油消费税征收额度与普通柴油相同，均为0.8元/升。
“这是由于当时出现了普通柴油冒充生物柴油出售的苗头。”一位知情人士说。但加上这0.8元/升的消费税后，生物柴油彻底成了一门亏钱生意。孙善林表示：“很多企业无法支撑，就离开了。”
即使留下来的企业，也在自寻其他出路。唐山金利海生物柴油股份有限公司负责人刘德江说，公司近年来的产品主要销往化工市场，作为塑料添加剂。该公司明年产能达6万吨，消费税免征政策出台后，他对明年生物柴油市场持乐观态度。但具体产量能有多少，其中又有多少能作为替代燃料出售，他心里没底。
在上述山东企业代表看来，塑料添加剂市场显然更具吸引力，8000多元/吨的价格至少能保证企业盈利。
对他们的做法，孙善林能理解，他说：“化工产品没有消费税，价格也不错。”
事实上，除了用作化工原料，生物柴油厂家也没有更好的销售渠道。上述山东企业代表说：“由于没有国家标准，生物柴油并不能光明正大进入成品油销售网络掺混出售。以前只有民营加油站会适量进一些货，价格也压得很低。”
2007年国家发布实施了《柴油机燃料调合用生物柴油（BD100）国家标准》，但对于在石化柴油中应如何添加生物柴油、添加比例是多少却没有明确和严格规定。直到今年9月底，《生物柴油调和燃料（B5）标准》（2％～5％的生物柴油与95％～98％的石油柴油调合而成的燃料标准）才正式发布，并定于明年2月1日起实施。生物柴油因此获得了进入成品油领域的资格。
11月初，海南已开始试行封闭推广B5生物柴油。中海油新能源投资有限责任公司所产的首批生物柴油，开始在海南澄迈、临高的12家中石化旗下加油站试销。但对于众多民营生物柴油厂商而言，由于中石油和中石化把持着全国主要成品油销售渠道，他们对于未来能否真正进入这一渠道依然心存疑虑。
“谁来调配？产品质量标准如何把控？配套政策如何实行？这些问题都有待解决。”刘德江说，“政府应出台更多的配套政策。”
原料收集就是配套政策中重要的一项。目前我国废油脂产量有限，各地大多没有正规回收企业，颇为混乱，这影响了生物柴油的原料供应。上述山东企业代表认为：“现在真正赚钱的不是生厂商，而是地沟油收购企业。”在他看来，最好的解决办法就是由政府出面，选定专门回收废油脂的排他性正规定点企业，规范地沟油回收。
另外，生物柴油企业希望政府能在财税方面给予整个行业更多扶持。据专家介绍，2008年美国的生物柴油产能就超过700万吨，其中60％～80％原料为大豆。美国的扶持政策主要包括增加需求、减少成本、减免消费税和资金支持。
2010年2月发布的美国可再生燃料标准（RFS2）要求，2020年生物燃料总量达1360亿升，其中生物柴油产量达40亿升。其税收减免标准为：以大豆为原料的生物柴油减免税1040.4元/吨（已折算为人民币，下同），以餐饮废油生产生物柴油减免税2080.8元/吨。农业资源所生产的生物柴油，参与调和1加仑补贴1美元。
知情人士告诉记者：“财政部相关官员已表达了扶持意愿，但在哪个环节，如何扶持都还需要进一步研究。”
