某乳品厂隶属于某市商业局，由于计划体制、行政体制的束缚，该企业一直实行大而全、小而全的组织形式，内部设有牧场和乳品加工分厂两个分部，牧场生产的原奶经乳品加工分厂加工成花色奶后出售。
新税制实施之初，该企业在原有的组织形式下税负增加很大，因为依据新增值税有关政策的规定，该厂为工业生产企业，不属于农业生产者，其最终产品也非农产品，因而其加工出售的产品不享受农业生产者自产自销的免税待遇，而依据增值税条例的规定，该企业可以抵扣的进项税额主要是饲养奶牛所消耗的饲料，包括草料及精饲料，而草料大部分为向农民收购或牧场自产，因而收购部分可经税务机关批准后，按收购额的10％（按照现在的政策应当是13％）扣除进项税额，精饲料由于前道环节（生产、经营饲料单位）按现行政策实行免税，因而乳品厂购进精饲料无法取得进项税额抵扣凭证-增值税专用发票，所以，纵观乳品厂的抵扣项目，仅为外购草料的10％以及一小部分辅助生产用品，但是该企业生产的产品花色奶，适用17％的基本税率，全额按17％税率计算销项税额，销项减去进项税额为该企业的应交税金。该企业1994年税负达到了13％以上，大大超过实施新税制之前的税收负担，也影响了企业的正常生产经营。
1995年伊始，该企业及上级主管部门经研究，决定将牧场和乳品加工分厂分开独立核算，分为两个独立法人，分别办理工商登记和税务登记，但在生产协作上仍按以前程序处理，即牧场生产的鲜奶仍供应给乳品加工厂加工销售，但牧场和乳品加工厂之间按正常的企业间购销关系结算，这样处理，将产生以下效果：
作为牧场，由于其自产自销未经加工的农产品（鲜牛奶），符合农业生产者自销农业产品的条件，因而可享受免税待遇，税负为零，销售给乳品加工厂的鲜牛奶价格按正常的成本利润率核定。
作为乳品加工厂，其购进牧场的鲜牛奶，可作为农产品收购处理，可按收购额计提10％的进项税额，这部分进项税额已远远大于原来草料收购额的10％，销售产品，仍按原办法计算销项税额。经过以上的机构分设，解决了原来企业税负畸重的矛盾，而且也不违背现行税收政策的规定。
