传统的国家重点实验室都是建立在高校或科研院所，由高校和科研院所做出成果后再向企业转化。这种方式有其一定合理性，但却过于线性，既造成了科技成果创造与经济领域使用的脱离，也没有考虑到企业与产业内生创新能力的培养。
近些年来，中国的科研经费大幅度上升，占世界研发总支出的12.8%，已经成为世界第二大研发国家，企业研发投入比重也已超过70%。按理说，这么大的研发经费支出特别是企业研发投入，应该带来企业与产业技术创新水平的大幅度提升，但实际情况却并不乐观。就拿最具产业规模的中央企业来说，还没有完全摆脱高投入的外延式增长模式，缺少具有自主知识产权的关键技术和知名品牌，缺少关键技术、大型成套设备、核心元器件、重要基础件、关键新材料，过多依靠引进国外技术等问题突出。造成这种问题的深层次原因，正是我国企业与产业的基础及应用基础研究相对薄弱，科研成果转化为生产力的有效机制尚未形成。
现在，把国家重点实验室直接建立在企业内部，就是为了给企业与产业以内生的创新动力，就是为了从深层次解决科技成果转化问题、科技与经济脱节问题。这些实验室的建立，更注重紧跟国内外产业发展趋势，更注重带动产业发展的重大技术问题研究，更注重衔接市场需求和应用基础研究，这就可以为产业发展提供持续的技术来源。把握住这一内在规律，就能充分认识在企业建立国家重点实验室的重大意义。
有人认为企业搞基础研究不重要，这种认识是偏颇的。从国际经验看，提升企业的基础研究能力、原始创新能力至关重要。早在1851年伦敦举行的万国博览会上，美国的创新成果大放异彩，英国议会派人了解原因所在，总结出美国创新的关键就在于“在企业运转中盛行的普遍智慧”。最伟大的发明家爱迪生正是美国企业创新传统的开创者之一，他的成就不仅是拥有1093项专利，更在于强调原创与市场的结合，1869年，刚刚22岁的爱迪生就下决心“我不想再发明任何卖不出去的东西了”。美国科技史认为“爱迪生凭借科学来进行创新，但又创造了进行创新的科学——把发明开发出来建成完整的工业”。
当前，美、欧、日等发达国家的大企业在研发投入强度高的行业中仍占主导地位。美国企业的软件和计算服务研发投入占全球的75%，IT硬件研发投入占全球的48%，医药研发投入占全球医药研发总投入的43%。相比之下，我国的企业研发投入还很有限。即便是企业国家重点实验室的建设经费主要也是依靠企业自筹，压力很大，影响了实验室建设进程和积极性。缺乏稳定与足够支持的企业实验室无法集中力量开展攻关，不能关注中长期基础研究，模仿多于原创。“十二五”期间，创新驱动发展转型的任务紧迫，企业作为创新主体的能力提升要求紧迫，这就要求政府应该把更多的创新资源聚集在企业，这不但是落实国家创新战略的必然之举，更是国际创新经验的共同选择。
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