《药品管理法实施条例》（2002年9月15日起施行）
《中国人民解放军实施〈中华人民共和国药品管理法〉办法》（2005年1月1日起施行）
《疫苗流通和预防接种管理条例》（2005年6月1日起施行）
《麻醉药品和精神药品管理条例》（2005年11月1日起施行）
《易制毒化学品管理条例》（2005年11月1日起施行）
《医疗器械标准管理办法》(试行)（2002年5月1日起施行）
《中药材生产质量管理规范（试行）》（2002年6月1日起施行）
《药品监督行政处罚程序规定》（2003年7月1日起施行）
《药物非临床研究质量管理规范》（2003年9月1日起施行）
《药物临床试验质量管理规范》（2003年9月1日起施行）
《医疗器械临床试验规定》（2004年4月1日起施行）
《药品经营许可证管理办法》（2004年4月1日起施行）
《药品不良反应报告和监测管理办法》（2004年3月4日起施行）
《国家食品药品监督管理局关于涉及行政审批的行政规章修改、废止、保留的决定》（2004年7月1日起施行）
《互联网药品信息服务管理办法》（2004年7月8日起施行）
《医疗器械说明书、标签和包装标识管理规定》（2004年7月8日起施行）
《生物制品批签发管理办法》（2004年7月13日起施行）
《医疗器械生产监督管理办法》（2004年7月20日起施行）
《直接接触药品的包装材料和容器管理办法》（2004年7月20日起施行）
《药品生产监督管理办法》（2004年8月5日起施行）
《医疗器械经营企业许可证管理办法》（2004年8月9日起施行）
《医疗器械注册管理办法》（2004年8月9日起施行）
《医疗机构制剂配制监督管理办法》（试行）（2005年6月1日起施行）
《保健食品注册管理办法（试行）》（2005年7月1日起施行）
《医疗机构制剂注册管理办法》（试行）（2005年8月1日起施行）
《国家食品药品监督管理局药品特别审批程序》（2005年11月18日起施行）
《进口药材管理办法（试行）》(2006年2月1日起施行)
《国家食品药品监督管理局听证规则（试行）》(2006年2月1日起施行)
《药品说明书和标签管理规定》(2006年6月1日起施行)
《蛋白同化制剂、肽类激素进出口管理办法（暂行）》(2006年9月1日起施行)
《易制毒化学品进出口管理规定》(2006年9月21日公布，自公布之日起30日后施行)
《麻黄素类易制毒化学品出口企业核定暂行办法》(2006年10月10日公布，自公布之日起30日后施行)
