产业基地迅猛发展重大专项在江苏实施的项目有98%落户在泰州、连云港、南京、苏州、无锡、常州等六大产业基地，成吸引和集聚国内外创新资源的重要手段，提升了产业的集约化水平，目六大产业基地产值已占全省总量的70%以上。泰州医药城资源集聚效应进一步凸显；苏州医疗器械产品群、基因工程产品群和生物纳米技术产品群正在崛起；昆山成为全国小核酸产业的集聚之地；无锡初步建成了具有国际竞争力的高端生物医药服务外包基地。
科技平台体系不断完善重大专项的实施有力促进了江苏一批高水平科技创新平台的建设，依托泰州医药城孵化基地项目，江苏先后投入近亿元，配套建设了大小分子、安评中心、疫苗基地等10余个科技平台，构建了医药城新药研发技术体系；依托综合性新药研发大平台，加强机制创新，引导高校主动为企业服务；依托企业技术平台，提升产品和企业的竞争力，先声药业依托抗肿瘤分子靶向药物与脑血管药物集成创新技术平台，大幅提高“必存”的纯度，今年销售有望突破10亿元。
新药研发能力持续提升重大专项的实施为医药产业发展提供了大批创新项目源，如2008年圣和药业获重大专项支持的一类新药左旋奥硝唑和恒瑞医药的艾瑞昔布，均已获批上市，预计5年内都可达到5亿元的规模。今年1~6月，全省新药申请194个，获批临床批件56个，均居全国第一；获批上市13个，其中一类新药2个，目前江苏一类新药拥有达到40个。
骨干企业逐步壮大重大专项的实施对医药企业创新能力建设、大品种改造、产学研合作、产业化水平提升发挥了重要作用，同时也引导带动了企业研发投入的持续增加，先声、恒瑞、天晴、康缘等企业研发投入占销售额比例已在7%以上。恒瑞的西他赛、天晴的甘草酸系列等大品种改造都获得了重大专项的支持，年销售均超过了7亿元。目前，江苏拥有年销售超亿元的医药品种有92个，其中超10亿元的10个，大品种药物数量全国第一。扬子江药业居全国医药工业百强之首，恒瑞医药位中国最具竞争力医药上市公司20强榜首，正大天晴在肝病药物和甘草制剂方面居世界领先地位，康缘是中药行业拥有新药证书和国内外发明专利最多的企业。
高端人才加速集聚通过国家重大新药专项个平台，江苏加大了海内外高层次人才和科技创新团队的引进力度。近年来，全省引进的各类高层次人才中，国家“千人计划”获得者36人，省高层次创新创业人才支持204个。2010年江苏首批资助支持的8个科技创新团队中，有3个是生物医药研发团队，使江苏省在肿瘤药物、抗体药物等领域紧跟国际前沿。
创新国际化进程明显加快江苏已成为国际医药产业和资本转移的首选之地，阿斯利康、惠氏等10家世界500强跨国制药公司落户江苏。江苏与以色列合作签订了“江苏-以色列产业研发专项资金”，医药领域是重点支持方向。本土医药企业也以科技创新拓展国际市场空间，扬子江药业、江山制药、恩华药业等一批企业制剂车间或产品通过欧盟GMP认证；恒瑞、豪森接受美国FDA认证，企业产品走向欧美市场；先声药业与百时美施贵宝联手研发抗癌药物；药明康德已成为全国第一、全球第二的医药外包企业。
