调控基因编码辅助蛋白，调节病毒蛋白合成和复制。tat等6个基因被称为调控基因，分别表达6种蛋白质，对病毒复制起调控作用，只有nef起负调节作用，其它均有促进病毒复制的作用，tat（transactivator）反式激活因子， rev（regulator of virion proteins）毒粒蛋白表达调节因子， nef（negative regulatory factor）负调控因子，vpr，病毒r蛋白， vpu，病毒u蛋白， vif（virion infectivity factor）病毒感染因子。
HIV-1的生活周期，如图3所示，HIV的生活周期包括粘附、脱衣壳、逆转录、环化、整合、转录、翻译、核心颗粒装配及最后装配和出芽等步骤。HIV-1复制过程包括粘附与穿入、逆转录、整合、转录、翻译、装配与芽生。
粘附与穿入：HIV侵入步骤，HIV的env蛋白GP120和细胞表面CD4受体结合，结果导致V3-loo和V1/V2 区构象改变，暴露原GP120隐藏的区域，称为桥层（bridging sheet），该区与辅助受体相互作用，通常为CCR5或CXCR4，辅助受体结合最终触发膜构象改变，并导致膜融合，脱去包膜和核衣壳，病毒核酸侵入细胞内。
病毒复制：病毒RNA在逆转录酶催化下，形成线状的双链DNA，环化成闭合的双链DNA，后者被转运到细胞核，整合到细胞染色体中，形成前病毒，转录的病毒mRNA翻译病毒蛋白和转录病毒RNA，翻译的病毒蛋白经蛋白酶切割，包膜蛋白在内质网糖基化，形成GP120、GP41、P24等蛋白，病毒基因组、逆转录酶结构及调节蛋白以及包膜蛋白包装形成完整的病毒颗粒。
因为HIV-1前病毒共价地整合于宿主细胞染色体中，故在宿主基因中稳定存在，并可复制传入子代细胞DNA中。整合的前病毒可以长期结合于宿主细胞基因中，并可以长期潜伏下来，或者病毒复制，产生大量的子代病毒。
通过性途径传播，HIV 最先感染人的树突状细胞（DC），HIV和树突状细胞的DC-SIGN结合， DC-SIGN是四聚体膜蛋白，末端有植物血凝素连接区，HIV通过细胞膜DC-SIGN糖链相互作用和DC-SIGN结合，带有HIV的树突状细胞，在淋巴结内感染表达CD4和辅助受体的单核巨噬细胞，称为顺式感染 （infection in cis），也可以通过DC将HIV提呈给邻近表达CD4和辅助受体的CD4+T细胞，则称为反式感染 （infection in trans）。
细胞嗜性和辅助受体： HIV特点是选择性与CD4分子结合，有高度的亲嗜性。除CD4+的T淋巴细胞外，已知一些其它细胞亦能表达CD4，并能复制HIV-1.这些细胞包括血液中的单核细胞，组织的巨噬细胞，皮肤的郎罕氏细胞，中枢神经系统的小神经胶质细胞和多核巨细胞。病毒穿入细胞，不仅需要CD4受体，还需要第二受体的帮助，通常是趋化因子受体，如CCR5、CXCR4这种受体称辅助受体，在巨噬细胞表面的辅助受体为CCR5，在CD4+T细胞表面的辅助受体为CXCR4，CCR5△32纯合子突变，导致CCR5△32缺失，缺失宿主可不感染HIV，CCR5△32杂合子缺失，可使病程进展缓慢。根据辅助受体的不同（CCR5、CXCR4），病毒分为R5和X4毒株，病毒新感染人体以R5株为主，复制速度慢，病毒量少，称低/慢型，感染一段时间后，病毒转化为X4株为主，复制速度快，病毒量多，称快/高型，快/高型病毒为合胞体诱导株（SI，病毒培养产生细胞融合），低/慢性病毒为非合胞体诱导株（NSI）。
HIV动力学：血浆游离病毒半衰期30分钟，产毒的T细胞半衰期1.6天，产毒的单核细胞半衰期15天，整合后不产毒的CD4+淋巴细胞（记忆细胞）半衰期可长达数年，HIV每代2.6d（一个毒粒释放-感染另一个细胞释放新的毒粒），因此每年140代或更多的周期，DC细胞的半衰期15天。HIV高速复制每天产生10-12亿个新病毒颗粒，因为逆转录病毒在逆转录过程和转录RNA过程不符合细胞校正机制，且逆转录酶缺乏3‘-5’外切核酸的校读功能，使RNA转录为DNA时经常出现错误， 在复制周期中核苷酸错误率大约为10-4/每个核苷酸，每天突变的HIV-1在1万个以上。
HIV能耐受低温而对高温敏感，煮沸可迅速灭活，室温下液体环境中HIV可存活15天，被HIV污染的物品至少3日内有传染性，液体（即使含10%血清）中的HIV加热56℃10分钟即可灭活。干燥状态下外界蛋白质对HIV有显著保护作用，真空冷冻干燥的血制品加热68℃72小时才能保证所含HIV被灭活，HIV对甲醛、戊二醛、乙醇、卤族化合物敏感。37℃时，以下消毒剂处理10分钟，可灭活HIV，如常用的消毒剂如70%酒精、10%漂白粉、2%戊二醛、4%福尔马林、35%异丙醇、0.5%来苏和0.3%过氧化氢等均能灭活病毒。消毒效果受以下因素制约：温度、消毒剂浓度、作用时间、病毒数量、病毒株别、有无其它蛋白质及杂质。对紫外线不敏感。
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