事业单位改制后的首要问题是生存与发展，有三个方面的问题要解决：一是改制后的事业单位要成为按照市场规律运作的企业;二是要能够独立生存，并且不断发展壮大;三是要根据战略定位，构建符合自身特点的赢利模式，把体制内的资源转化为在市场上可以销售的东西。
事业单位改制的重点表现在两个制度上，一是劳动制度，要推行全员聘用制和岗位管理制度，二是分配制度，要按市场经济和价值规律衡量贡献，进行按劳分配。现在，事业单位的领导都有行政级别，这是与公司化运作很不相适应的。世界上有很多知名的大企业的管理人员都是没有行政级别的，比如麦当劳公司等。
事业单位改制的方向是转向企业化经营。现代企业是由一组领取薪水的高、中层经理人员所管理的，企业资产所有者和经营者相分离的多单位企业。现代企业制度是市场经济体制的基础，公司制度是现代企业制度的主体。
所谓公司制度，就是指适应社会化大生产和现代市场经济要求的公司法人制度，其表现形式主要有两种：一是有限责任公司，人合资合兼具、股东人数有上限、募股集资是封闭的、组织结构是简单的;二是股份有限公司，它是典型的资合公司、股东人数有下限、募股集资公开、全部股份是等额的、股份可自由转让、设立要求严格。
现代企业制度的内容可概括为四句话：产权明晰、责权明确、政企分开、管理科学。现代企业制度由产权制度、组织制度和管理制度三部分组成。
现代企业产权制度确立了企业的法人地位和企业法人财产权。这里，要注意，法人不是人，法人是机构。财产权如何理解，举个例子，假设你有10万块钱，存在银行，这是你的个人财产，但如果你用它入股了某个企业，这10万块钱就由资金变成了资本，你有了这些股份所对应的产权，你不想要了可以转让，这保证了法人财产的稳定。
现代企业组织制度确立了公司治理形式，要以合理的企业组织结构，确定所有者、经营者和职工三者的制约关系。
现代企业管理制度确立了公司的运行规则：企业要承担风险和创造利润，就要按规律运行。要建立现代企业管理制度，在管理思想、管理方法、管理手段、管理技术等方面实现现代化，建立战略管理、组织管理、营销管理、生产管理、研发管理、人力资源管理、财务管理、质量管理等一系列管理体系，保证企业健康运转。
