首先填写A000000《企业所得税年度纳税申报基础信息表》，完成填报后点击“下一步”进入《企业所得税年度纳税申报表填报表单》界面。
在《企业所得税年度纳税申报表填报表》中，系统会根据基本信息表中的填报信息，默认检查所需表格；同时，您可以根据需要添加和检查其他可选表单。检查完表格后，点击“下一步”进入主附表填写界面。
在主附表填写界面中，屏幕左侧为已检查需要填写的表格列表，右侧为相应的表格格式。您可以单击左侧列表中的表单名称，切换到需要填写的表单格式。切换表单时，不需要逐个保存，表单间有勾对关系的数据会自动关联带入。
为了保证申报的准确性，在填写表格时，所有表格，无论是否填写了数据，都需要逐个打开，否则无法完成申报。
如果您在填写时发现需要增加或删除该表，或者需要修改企业所得税年度纳税申报表a000000基本信息表的数据，可以点击“上一步”按钮进行申报并进行相应修改；处理完毕后，返回主附表填写界面，填写的数据不会丢失。
如果需要多次填写表单，可以在退出声明功能之前使用“临时”或“保存”功能。“临时存储”的功能是保存当前填写的数据，无需进行相应的逻辑验证；“保存”功能是先对表格中填写的内容进行逻辑验证，逻辑验证正确后保存数据。
在“临时存储”或“保存”数据后，当您下次进入申报功能时，系统会提示您是否需要恢复上次填写的数据。选择“确定”读取上次保存的数据并继续填写。选择“取消”再次填写。
此次升级启动了申报单导入功能。使用此功能，您可以先下载申报单模板，离线完成数据填写，然后登录电子税务局导入填写好的模板完成申报。具体操作如下：
单击〖确定〗按钮，进入导入界面。您可以先下载导入模板。该模板是Excel格式的申报表。模板表格包括所有申报表格。填写时可以选择要填写的勾选表单（即使未勾选填写的数据，也不会将未勾选的表单导入申报系统）。填写完毕后，点击“导入数据”完成导入；需要注意的是，如果您以前填写过表单数据，导入后会清空以前的表单数据，以本次导入的数据为准。
导入后，返回表单填写界面，可以继续修改填写的数据。
表单全部填写完成后，在申报前您可先点击“政策风险提示服务”功能扫描本次申报数据的风险点；该功能您自行选择是否使用。
表单填写完成后，点击“申报”，如果有系统监控信息，请按照监控信息的指引完成数据修改；
申报成功后，如果您在企业所得税的最终结算中多缴税款，系统会提示您申请退税（抵免）。点击“申请”按钮后，系统将跳转到最终结算支付的退税（抵免）申请功能，自动帮您填写退税（抵免）申请单。确认无误后，提交单据完成申请，可在电子税务局的“我要查询——办税进度及结果信息查询——网上申请单据结果查询与征集”中查询处理结果。
