最让人诟病的是百度的商业模式。利用“价高者得”的竞价排名，“人工干预”提升关键词关联网站的排名。这种做法让百度游走于在法律和商业道德的边缘，一些虚假广告和违法网站利用漏洞，以更高的价钱获取更明显的广告位。
百度价值观的错，不仅仅在核心的搜索引擎服务。当初为了吸引更多的流量，百度制造了百度文库和MP3等产品，同样因为侵犯创作者利益，遭遇一致声讨。
贾平凹和韩寒等作家曾指责百度文库是一个“贼赃市场”。自上线以来，大量的文学作品以网友的名义被上传到百度文库中，盛大文学CEO侯小强破口大骂：“百度文库不死，中国原创文学必亡”。
这本质上是百度骨子里的自私。海归背景的李彦宏不可能不知道版权保护的重要性，但百度却盗用版权“红利”，赚得盆满钵满，而苦了一代音乐与文学领域的从业者。
三观不正也罢，让人最恶心的，是百度屡教不改的态度。
2008年央视曾多次曝光百度的竞价排名黑幕真相。2009年央视春晚，李彦宏代表百度成为全场最受关注的人物之一，电视镜头扫到他八次之多。这背后据说是百度砸下4000万元给央视，希望通过宣传曝光，美化企业形象。由此可见，面对如此严重的道德问题，百度的主要处理措施不是改正，而是掩盖。
反观阿里巴巴，淘宝虽然同样多次被质疑假货问题，但马云从多个方面表现出整改假货的决心。比如2004年淘宝“欺诈门”事件，马云表现惊人，在内部邮件上写到：我们不是一家不会犯错误的公司，可能经常在未来判断上犯错误，但绝对不能犯原则妥协上的错误。于是果断请辞卫哲，自我革命强烈，公关能力迅速，也反映了阿里巴巴完善的组织机构和高凝聚的企业文化。
自我改革缓慢，官僚主义盛行，是百度多年以来的积病。在谷歌退出中国后，百度几乎垄断了搜索市场，这种安逸的环境让它逐渐成为了一家完全以销售为导向的公司，与其搜索创新的起家之路逐渐背道而驰。百度有的医疗销售经理一天审核一批有问题的商户就能赚10万元。据公开报道，百度2013年广告总量为260亿元，莆田系就占了120亿元。从“血友吧”到“魏则西”，百度和莆田系相互伴生，谋取利益，畸形发展。
不仅仅是医疗竞价，罪恶的价值观正在吞噬这家互联网巨头。比如原百度副总裁王湛，有人爆料，2014年8月，百度游戏事业部副总监廖俊因“严重违反公司职业道德纪律”被解除劳务合同，交由公安机关调查。“廖俊是由王湛从趣游挖来百度的，在百度游戏运营期间，存在流水回扣的关系，最后的分成回馈给廖俊和王湛。”
组织溃散，权力断崖。据知情人士透露，在百度的组织内部，有一个由几个高层管理组成的决策层，他们往往决定了百度的战略方向，几乎很少能过滤到让李彦宏那里让他“操心”。
前几个月，李彦宏在电视媒体上说道：“经常冒出来一个项目我从来没有听说过，而且存在多个团队做同样的事情，我不允许这样的事情发生。”内部竞争严重，为了趋利，重复的去做一些事情，没有创新力，没有凝聚力。
然而归根结底，任何问题最终都是人的问题。或许李彦宏没有错，但是他却要承担主要责任。
一直以来，李彦宏是一个温和的人。长相斯文，着装得体。他做很多事情之前会和张亚勤、王劲商量，没多大脾气，客客气气，笑容腼腆的理工男。他技术出生，热爱数据，曾经差点成为一名硅谷的工程师。李彦宏十分看重技术和产品，“程序员在百度的地位比其他职位要高很多。”
但单纯的技术往往是冷酷的，缺乏温度的。和任正非、王健林甚至马云不一样，李彦宏不是“从地里面长出来”的商人，他少了点人情味。铁血手腕、中央集权、企业独裁者，这些词汇对于他来说或许太困难。
同样，危机感薄弱，优越感太强，也是百度的问题。百度作为技术大鳄，搜索一直以来是其底牌，在过去PC时代市场份额巨大，但是面对移动互联网“船大难掉头”。
李彦宏不是没有意识到企业的问题，但与腾讯社交产品和阿里巴巴金融产品的创新相比，百度在移动端始终没有找到好的突破口。即便投资去哪儿和糯米，但传统业务线羸弱，新产品市场转换低，移动端搜索不作为，020定位又不清晰，百度市值一直下滑。2015年，百度市值蒸发掉590亿人民币，不及阿里巴巴和腾讯的三分之一，同时京东小米环伺，BAT地位岌岌可危。
而反观昔日对手——大洋彼岸的谷歌，市值已经是百度的近10倍，从智能机器到卫星地图，正在探索人类与宇宙的奥秘。对于百度而言，这也太讽刺了。
