急性鼻窦炎免疫功能正常的社区获得性急性鼻窦炎患者几乎都呈病毒性(如鼻病毒、流感病毒、副流感病毒)。一小部分会发展为继发性细菌感染(致病菌有链球菌、肺炎双球菌、Haemophilus influenzae、 Moraxella catarrhalis, 或葡萄球菌)。有时,上颌牙齿的根尖周脓肿会蔓延到被覆窦。医院获得性急性感染以细菌性感染更常见,通常包括Staphylococcus aureus、Klebsiella pneumoniae、 Pseudomonas aeruginosa、 Proteus mirabilis, 和 Enterobacter。免疫功能低下的病人可患急性真菌性鼻窦炎 (见 免疫缺陷患者侵袭性鼻窦炎)。
慢性鼻窦炎涉及很多导致慢性炎症综合因素。 如慢性过敏、鼻结构异常(例如,鼻息肉)、环境刺激(如空气污染和烟草烟雾)、粘液纤毛功能障碍以及其他致病微生物感染引起慢性鼻窦炎的因素。常见的致病微生物为细菌性(可能为黏膜表面生物膜的一部分),也可能是真菌。涉及多种细菌,包括格兰阴性杆菌和口咽厌氧微生物。多重微生物感染较为常见。少数情况下,慢性上颌窦炎可继发于牙源性感染。真菌感染(Aspergillus、 Sporothrix、Pseudallescheria)可以是慢性的并且倾向发生于老年患者和免疫力低下的患者。
过敏性鼻窦是一种慢性鼻窦炎,表现为弥漫性鼻腔充血,黏稠的鼻腔分泌物,常伴有鼻息肉。为机体对鼻窦内存在的 Aspergillus, 等真菌的过敏反应,并非细菌入侵造成感染。
侵袭性真菌性鼻窦炎 在免疫功能低下的患儿是一个快速进展的,有时甚至是致命的感染,多由 Aspergillus 或者 Mucor 所致。