WTO的宗旨是推进贸易自由化，以非歧视贸易(即"最惠国待遇"和"国民待遇")、稳定的可预见的市场开放、促进市场公平竞争以及鼓励发展和经济改革四大原则来达到各成员国之间以及世界贸易自由化的目的。轻五大职能来为各成员国排忧解难，一是管理并执行形成世贸组织的多边贸易协定及简单多边协定;二是作为多边贸易谈判场所;三是设法解决贸易争端;四是监督审议成员国的贸易制定及贸易相关的国内经济政策，从而实现全球经济政策制定的统一性;五是与其他参与全球经济政策的国际组织进行合作(国际货币基金组织和世界银行)，并组织编写年度世界贸易报告和举办世界经济与贸易研讨会，向发展中国家提供必要的技术援助。
加入WTO，对我国来说是一个严峻的考验和巨大挑战，当然机遇与挑战同存，对医药行业也一样。用三句话可以简单概括：加入 WTO，给医药行业带来机遇，更带来挑战;加入WTO，给医药行业带来的冲击不可小视;加入WTO，总的来看对医药行业是利大于弊。我们对加入WTO带来的机遇要好好抓住，要加快改革，加快发展迎接挑战。加入WTO，我们要同国外医药企业多领域、多范围的竞争，这种竞争无论是竞争方法、还是竞争手段，都将使我国医药市场格局发生巨大变化。
我国医药行业是我国对外开放比较早的行业之一，世界大的医药企业大多数已经进入中国市场，或办合资企业，或在中国市场推销其药品，中国市场已是一个国外医药公司与国内企业竞争的场所。我国加入WTO，使我国医药更好地融入世界医药市场，有利于医药行业更快地引进外资和利用国外的新成果、新技术;有利于我国医药产品的出口，参加竞争;有利于学习国外技术和管理经验，提高管理和企业素质，提高产品档次;有利于按市场经济、经济全球化加快企业组织结构、产品结构调整，提高企业市场竞争能力。与此同时，我们也应充分认识到加入WTO带来的严峻挑战。加入 WTO，必然使我国医药行业与跨国医药公司竞争加剧。跨国公司无论在资金、规模、实力上，无论在市场营销、现代化手段、人才上，也无论在产品、技术、档次上，目前都是我国不可相比的。我国医药行业整体素质不高，大部分医药企业创新能力不强，大多数品种尚没有形成专业化、规模化生产的情况下，企业正在进入市场经济中同国外公司竞争。由于其经济实力和经济素质还不强，利用机遇能力尚显不足，抵御全球化带来的冲击的能力也很弱。加上我国医药市场不不规范，医药流通组织结构不合理，经营方式落后，效率不高、效益不高，加入WTO，带来的竞争和冲击不可小视。
加入WTO，按世贸组织宗旨和要求以及承诺，涉及医药的有以下方面：
知识产权：我国从1993年开始实施新的药品专利法，保护知识产权，对国外药品实施了不同程度的保护，行政保护期长达7.5年。
关税降低：目前我国药品进口关税在14%左右，要降到达6.5～5.5%，尚有10～15%下降空间，从关税来看：一是降低的余地不大，二是有个缓冲期5年，3～5年的关税保护，可以根据情况逐步降低关税。三是关税再降对进口药品来看优势不会有多大余地。
市场开放：加入WTO服务的对外开放，尤其分销服务方面开放，影响很大。允许国外批发商、零售商进入中国市场，这是必然的。中美关于中国加入世贸组织谈判中我国已承诺不迟于2003年1月1日允许外资企业在中国市场从事药品零售、批发业务，医药流通的对外开放只是个时间问题了。医药流通开放对医药行业将产生重大的影响，但是也应看到：一是尚有个缓冲时间--3年时间，二是开放是渐进的，先合资、后独资;先零售，后批发;先试点、后放开到全国;三是合资与独资都得按我国药品管理法规要求进行，同国内企业一样要申请、达标并取证;四是其企业，尤其是独资企业开发渠道和建立网络需要有个时间、投资过程;五是中国市场之大，非几个公司能占有，即使想占有，也不是短时间能达到的。
医药法规、政策：加入WTO，按承诺需公开和修改医药法规、政策，同世贸组织相一致，主要在知识产权保护，市场交易规则方面。我国近几年已经向这方面努力，差距有，但不会很大，修改有利于国外公司，同样有利于国内企业。
从我国医药行业现状来看，有的有优势、有的有差距、有的处于劣势。我国医药原料及中间体有优势，加入WTO更有利于出口;中药有优势、可以向国外发展;创新药的研制、生产受限制，尤其国外专利药。我国列入重点开发和发展品种有冲击，如半合成青霉素和头孢菌素抗感染类换代产品等，这些品种已研制多年、并投入大量资金、人力、物力。但不是不可仿制，而是急作仿制;制剂--国外在新药、专利药、技术、剂型上都有优势，我国在普药、仿制药、中药上有优势;医疗器械上高档的仪器、器械国外公司有优势，而在一般，通用、常用的医疗器械我国有一定优势;在商业方面进化论是市场观念、经营规模、经营方式、经营手段，也无论是资金、规模、人才都是同国外公司不可相比的。但是，开放以来我国医药商业企业已在经营思想、经营模式、经营方式上改革，以适应市场经济，一部分企业是可以同国外公司竞争的。
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