无论是从短期影响还是从长期趋势看，在经济全球化条件下，我国加入WTO将为国内农业带来重要的发展机遇。
第一，我国将享受WTO现有成员已经享有的好处，改善农产品出口环境。加入WTO后，我国能够享受到绝大多数国家的无条件最惠国待遇、发展中国家的优惠待遇、减少歧视性待遇，可以利用有关机制解决贸易争端等，优化我国农产品出口的外部环境。
第二，有利于扬长避短，加速调整国内农业产业结构。过去，我国维持粮食高自给率，是以一定程度的环境破坏为代价的。围湖、开荒、高化肥及农药投入等追求产量目标的措施，给我国生态环境带来的破坏影响已经相当明显。加入WTO有利于中国进口资源密集型的农产品，比如粮食、棉花以及油料，相当于中国进口一部分耕地和水资源，使国内生态环境得到改善;有利于出口劳动力密集型产品，包括水果、蔬菜、水产品、畜产品等农产品，促进我国的农业结构调整。
第三，加入WTO后，一方面，外资进入中国将会更容易，伴随这些投资，往往能带来最先进或较先进的农业技术，提高我国农业的管理水平和生产水平，有利于提升我国农产品质量;另一方面，我国与国外农业教育、科研、技术的交流与合作更为紧密和频繁，这将加速我国农业科技进步，促进我国农业科技进步贡献率的提高，因而带动中国农业生产能力的提高和农业综合素质的增强。
第四，有利于进一步深化我国农村经济体制改革。根据WTO的基本原则，参照国际规范，我国农业和农村经济体制将进一步深化改革，按照市场经济的基本规则，建立和完善国内农业宏观调控体系。另外，WTO规则对贸易体制的规范化也有相关要求，对加快农产品外贸体制和国内流通体制改革也会产生积极的推动作用。这对于实现我国农业的两个根本转变，增强国内农业综合素质，提高农业国际竞争力，具有积极的促进作用。
当然，加入WTO后，我国需要在遵守WTO有关规则的基础上，承诺降低农业贸易保护程度、逐步开放国内农产品市场，这意味着在参与世界农业贸易自由化的进程中，我国农业发展也面临风险和挑战。
第一，国内农产品市场面临开放的压力，国内农产品生产将面临国际市场的严峻挑战。加入WTO以后，根据WTO农业协议的规定要求取消非关税措施，各成员的农产品进口控制只能通过关税措施。WTO要求的这种进口控制方式的转变意味着各成员将逐步开放国内农产品市场。因而，加入WTO后，国内农产品市场面临对外开放的压力已不可避免。另一方面，随着我国农产品市场开放程度的不断加大，国内不具有比较优势的农产品生产也将面临世界市场的冲击。
第二，国家农业发展政策有可能受到被动调整，调整的空间也将受到规则约束。加入WTO，我国对农业生产的国内支持政策措施，要符合WTO农业协议的规则，国家农业支持措施尤其是农业投资的范围与力度将受到影响。今后我国在农产品价格保护制度、农民收入支持、生产资料价格补贴等方面的政策措施的制定与实施将受到WTO有关规则的约束。
第三，我国粮油等农产品进口的增加，直接加重国家外汇支出负担。一方面，在WTO框架下，随着农产品贸易自由化程度的不断扩大，各国给予国内农业生产和农产品出口补贴逐步减少，被扭曲压低的世界农产品市场价格(尤其是粮食价格)将呈上涨趋势;另一方面，从中长期趋势看，我国资源密集型的粮油产品国内供需将存在一定缺口，进口部分粮油产品将是一种趋势。随着我国农产品市场开放程度进一步扩大，外国优质低价农产品很容易挤进国内市场，这将增加我国进口粮油的外汇开支。
根据我国农业和农村经济发展的实际，我国应以加入WTO为契机，深化农业和农村经济体制改革;根据市场经济规则，进一步推进农业市场化改革;加强国内农业支持政策的研究，用好用足WTO规则;依靠科技进步，全面提高农产品品质，增强农产品的国际竞争力;加强市场研究，建立和完善国家农产品市场监测和预警体系等。
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