立案应按相关规定对违法基本事实予以确认,并在2日内按程序上报,予以立案。立案后送达调查询问通知书(当事人应携带包括法人身份证、单位营业执照等)、受理案件回执。取证案件承办人(二名以上执法人员)应在立案后7日内开始调查,询问当事人、证人、收集相关证据材料,制作调查笔录和现场勘验笔录,取得相关证据。责令通知书调查取证时,违法行为仍在继续的,应下达责令停止水事违法行为通知书、责令改正水事违法行为通知书,送达回证调查终结报告违法行为调查终结,案件主办人应在2日内制作水事违法案件调查报告,提出初步处理建议。。集体讨论水政监察机关应在3日内召集相关执法人员对案件主办人提出的初步处理建议进行集体研究,作出处理意见。合法性审查意见水行政机关法制科室应出具合法性审查意见书。
行政处罚决定书应当场交付当事人,应在7日内按相关规定送达当事人水事违法案件,应在批准立案之日起30日内做出处理决定,因特殊情况不能做出的,可以延长办案期限,但延长期限不得超过30日。结案案件处理完毕后,案件主办人应在5日内制作水事违法案件结案报告,经局主管领导批准结案,并将办案过程中形成的文书、图片、照片等资料编目,立卷归档票据当事人15日内到指定银行缴纳罚款,回执票据