根据《刑法》分则第164条第3款、第390条第2款和第392条第2款的规定，特别自首仅适用于犯有对公司和企业行贿罪、行贿罪、或者介绍贿赂罪的行为人。由于《刑法》对单位犯罪的规定是“法律规定为单位犯罪的，应当负刑事责任”。即单位犯罪的具体罪名由刑法明确规定，所以行贿罪和介绍贿赂罪的主体单位并不适用，单位不能成为上述两罪的犯罪主体，自然也就无从谈起上述两罪的单位犯罪特别自首。但是对公司、企业人员行贿罪不仅自然人可以构成犯罪主体，单位也可以构成犯罪主体。所以，在单位犯有对公司、企业人员行贿罪之后，完全有可能根据现行刑法第164条的规定成立特别自首。
《刑法》对单位犯罪在绝大多数情况下采取双罚制，即处罚直接负责的主管人员和其他直接责任人员，仅有极少数情况下规定了单位犯罪的单罚制，即只处罚直接责任人员而不处罚单位。所以单位犯罪的处罚与自然人的处罚是不同的，自然人的处罚中罚金刑只是附加刑。犯罪以后自首的可以从轻或者减轻处罚，其中，犯罪较轻的，可以免除处罚。落实到单位犯罪自首，免除处罚，自然和自然人犯罪一样，不用在适用刑罚。可是从轻、减轻又如何操作呢？《刑法》第62条规定：“犯罪分子具有本法规定的从重处罚、从轻处罚情节的，应当在法定刑的限度以内判处刑罚。”
同时第63条规定：“犯罪分子具有本法规定的减轻处罚情节的，应当在法定刑以下判处刑罚。”据此，在单位犯罪自首适用从轻、减轻的规定时，采取单罚制的情况下，对直接责任人员予以从轻或减轻处罚。即从轻时在法定刑的限度以内判处较轻的刑罚；减轻时，在法定刑以下判处刑罚。在适用双罚制的情况下，对单位犯罪自首的应分别对待。对单位的处罚，由于《刑法》对单位处罚的规定只有罚金刑一种，所以从罚金刑的角度考虑从轻、减轻。针对不同的单位犯罪，罚金刑又分为无限额罚金制、倍比罚金制以及限额罚金制等三种罚金刑。对于倍比罚金制及限额罚金制，在量刑需要从轻时可以在法定的罚金额以内判处缴纳较少的罚金，减轻时则判处缴纳最低法定罚金额以下的罚金。
对于无限额罚金，根据法律的规定先不考虑自首情节，确定应缴纳的具体罚金额，然后再考虑自首情节，在具体罚金额内予以减少或者免除。对自然人的处罚，则又分为两种情况。一般来说，单位成立自首，其内部责任人员也成立自首，因为这是单位整体意志自首的结果。这种情况下，对自然人的处罚即在法定刑的限度以内判处较轻的刑罚或者在法定刑以下判处刑罚。但是也存在着另一种情况，即单位整体自首的情况下，某些自然人拒不自首，抗拒检查，毁灭证据，这时对参与自首的，可以比照自然人犯罪自首予以从轻或减轻处罚，而对于拒不自首的则不适用自首的规定，即在这种情况下，单位成立自首，参与自首的自然人也认定为自首，但是对拒不自首的自然人不能适用自首。
