我国大数据应用面临着数据资源难以开放共享、数据安全和隐私急需保护、大数据技术创新人才不足等诸多挑战，其中个人隐私如何保护，是大众最为关注的问题。
事实上，真正好用的大数据技术，应该是用加工实现增值，用分析来指导决策，而非贩卖用户个性化隐私这种原始数据信息本身的低层次滥用。
中兴通讯首席架构师、业务总工程师罗圣美表示：“使用这些数据的企业，其实有两大类，一类是互联网企业，第二类是电信企业。企业有安全保护措施，有技术解决方案，做只针对群体，而不针对个体的信息挖掘，这是应遵循的基本原则。”
率鹏认为，在隐私保护问题上，大数据技术要重点强调符号化和用户特征这两个概念。“符号化，是当我们去识别一个用户时，用和他真实信息不相关的符号标记这个用户。符号通过算法来保证，是单向的识别，使我们能识别出两次登录的是同一个用户，却无法通过此符号反推出该用户在真实生活中的姓名、电话和住址，这就基本享受了大数据带来的优势，同时又规避了信息安全的风险。用户特征，是在大数据时代，企业感兴趣的往往是这个用户的特征，而不是家庭地址、电话号码真正敏感的信息。比如说，我希望知道你是一个20岁到30岁年龄段，生育过子女，有高等教育学历的女性，这些都是你的特征，但是我并不想知道你姓甚名谁，今年多大，有几个小孩。如果在数据使用过程中严格遵循符号化和用户特征原则，我们就能规避掉不良风险。”
除了技术以外，政策和立法才是大数据时代个人隐私保障的重要凭借。2012年12月28日，《全国人民代表大会常务委员会关于加强网络信息保护的决定》审议通过。2013年，工信部根据全国人大的决定，出台了关于互联网和电信网个人信息保护的条例，提出了数据保护的一系列要求。
数据需要保护，数据也需要交易。大数据的保护与交易需要遵循什么样的标准，是当前政策制定者面临的挑战。
张新生说：“有价值的数据是非常重要的资源，但前提是要建立交易规则。我国的几大互联网运营企业都在做大数据分析，并且都想把数据作为可交易的产品，这需要我们尽快建立数据交易有关的法律法规。”
何宝宏认为，目前的大数据分为两类。一类是公共数据，比如政府所掌握的数据，或者公益企业的数据，公共数据面临的是开放和共享的问题。一类是商业数据，商业性数据需交易，因为这是资产，交易产生新的价值。“标准和政策的制定是不断摸索的过程，需要随着市场去探索，我们已经深度地介入到关于目前国内数据交易的活动中，去探讨这方面的政策、标准制定。”
对于用户来说，提高信息安全意识、注意个人隐私保护也十分重要。不过，鉴于大数据时代个人隐私保护的困难程度，已有专家提出了“遗忘”的必要性。牛津大学教授、大数据领域权威专家维克托就在他的著作《删除》中表示，对于人类而言，遗忘一直是常态，而记忆才是例外。然而，由于数字技术与全球网络的发展，这种平衡已经被打破了。大量数字化的私人信息不仅可能在今天被滥用，在几年甚至几十年后仍然可能被滥用。
罗圣美说：“在大数据时代，建议国家相关部门在制定产业政策时，需要重点考虑涉及个人隐私的信息，采取删除、锁定，或者安全加密等多种级别的保密措施，避免个人隐私被检索、发现、滥用和扩散。”
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