关于转基因食品到底是有害还是有利，至少到目前为止是一个公婆都有道理的问题。按说人类现在所食用的食物基本没啥原生态的东西，那些原生态的玩意儿也根本不能吃。不信就去找个野生苹果树试试看，那东西酸涩不说，吃完了不闹肚子就算你肠胃坚强，有成为干部的基本素质。
但很多具有基本逻辑能力与科学常识的人也在质疑，原来的选种育种是一个比较长的过程，从作物到人都还有个适应的时间，而且基因的变化毕竟遵从着某些自然规律，不会有太出格的变异。而现在的根本是强行插入、暴力改善，不但没啥磨合期，也没有经过太长时间的长期影响观察，匆忙就高呼大救星到了，未免显得草率。
然后，这场争论就开始向纵深发展了，而且展现了具有中国特色、中国逻辑的层面。
支持的一方怀疑反对的一方是某些公司的枪手，实际就是为了打击这种能够救人类于水火以谋求自身商业利益的人派来的。这个说法是从美国与欧洲的这方面研究对比说起，意思是欧洲的农产品公司由于对这方面的研究不足，所以有目的、有计划的诋毁技术已经比较成熟的美国转基因产品，反对这件事的人其实是欧洲的农产品公司的枪手。
而他们的对手也毫不示弱，直接挖出中国曾经在“在2004年4月20日到期之前，给予美国进口转基因大豆以永久进口许可”的事情来，然后又找出美国大豆协会每年花了8000万美元的活动经费的说法——《21世纪经济报道》对此事的相关报道是：“事实上，美国大豆协会1982年即在中国设立了办事处，20年来通过举办研讨会、帮助农民种植大豆等各种方式开展工作，为美国转基因大豆涌入中国市场苦心经营。一项未经证实的数据是，美国大豆协会每年在中国市场的活动经费就有8000万美元之巨。这更是很像个阴谋嘛。还有个事情似乎更能说明问题：当年“中美商会”的主席马诚礼就倒霉在贿赂印尼政府官员，使得美国转基因产品种子进入印尼这件事上面。而这个商会可不是印尼美国商会，而是办事处在北京的“中美商会”。
事情进入到这个领域当中，大家就只能按照间谍小说与商战小说来看了，到底转基因食品如何已经隐入了一团迷雾当中。
抛开这个已经开始用中国逻辑进行辩论的事情不谈，转基因食品这件事最大的疑点还是不透明。转基因食品的斗士方舟子先生曾于2004年在北京的三味书屋做过一次讲座，当时正是转基因食品是否要标注的争论喧嚣尘上的时候。他的意见是不用标注，免得给大家造成不必要的恐慌。
很遗憾的是，由于各种各样的原因，我们这里的专家队伍信任值始终不算高，大概是为利益集团说得太多、以至于经常成为笑料的缘故。原本一个科学问题是可以放在表面上进行争论的，但要是放在了台面之下，哪怕您说转基因食品吃了以后“今年二十、明年十八”也不管用。更何况我们这里的食品安全始终是个大问题，这如何使得我们这些虽然已经被各路来历不明食物锻炼得异常坚强的人信服呢?
越是不透明就越会疑惑，而越疑惑则很多事情按照我们这里的潜规则就更加的不透明，以免造成面积过大的不明真相，两者恶性循环的话，转基因这件事就快成二人转了。
最近这件事又被拿出来说，各路专家还是这个路子的争吵，并且随便找了几个专家不透明的论证了一下，就宣布了某些每天都需要的转基因食品是安全的。当年还有专家论证周老虎为真呢，结果扇了自己一记大嘴巴。
所以，有时候科学的问题并不是纯科学，更多的是个社会问题。
