首先确定增值额与扣除项目合计的比例，看其结果介于税率中哪一个层次，然后运用公式“土地增值税税额＝增值额×税率－扣除项目金额×速算扣除数”进行计算。
举例如下：某房地产公司开发100栋花园别墅，其中80栋出售，10栋出租，10栋待售。每栋地价14．8万元，登记、过户手续费0．2万元，开发成本包括土地征用及拆迂补偿费、前期工程费、建筑安装工程费等合计50万元，贷款支付利息0．5万元（能提供银行证明）。
每栋售价180万元，营业税率5％，城建税税率5％，教育费附加征收率3％。问该公司应缴纳多少土地增值税？
计算过程如下：转让收入：180×80＝14400（万元）
取得土地使用权所支付的金额与房地产开发成本合计：（14．8＋0．2＋50）×80＝5200（万元）
房地产开发费用扣除：0．5×80＋5200×5％＝300（万元）
转让税金支出：14400×5％×（1＋5％＋3％）＝777．6（万元）
扣除项目合计：5200＋300＋777．6＋1040＝7317．6（万元）
增值额＝14400－7317．6＝7082．4（万元）
增值额与扣除项目金额比率＝7082．4／7317．6×100％＝96．79％应纳增值税税额＝7082．4×40％－7317．6×5％＝2467．08（万元）
