本质上说，仲裁是建立在社会公信基础之上的私人裁判制度，当事人意思自治是仲裁制度的基石。国家既然承认仲裁制度本身的合法性，并以反映当事人意愿的仲裁协议作为仲裁机构行使管辖权的基础，那么尊重当事人的意愿就应当成为仲裁协议效力认定最重要的标准。仲裁协议是当事人自愿将他们之间的争议交付仲裁的纠纷解决协议，反映了当事人对争议解决方式和争议裁判者的选择，是当事人意愿的载体。它的最大功能在于反映当事人的仲裁意愿，即表明双方当事人将纠纷交付仲裁解决的共同意愿。无论从仲裁理论的角度，还是从仲裁实践的角度看，当事人的意愿对仲裁协议的效力认定具有决定性的作用，充分尊重当事人通过仲裁协议所反映出的仲裁意愿是仲裁协议效力认定应遵循的基本原则。
仲裁制度建立在当事人意愿之上，当事人的意愿是仲裁制度最根本和最显著的特征。早在仲裁制度被国家法律承认之前，虽然当事人提交中立的第三者解决纠纷并不需要严格意义上的仲裁协议，并且，仲裁协议也不具有法律上的约束力。但当事人共同的仲裁意愿仍然构成了仲裁能否进行的基础。在仲裁制度被国家承认之初，虽然法院总是以厌恶和不信任的眼光看待仲裁，但在判定仲裁协议效力的问题上，当事人的意愿却被看做是认定仲裁协议效力的基础。英国1950年《仲裁法》虽然赋予法院对仲裁行使极大的司法监督权，并且根据该法第4条第1款，英国法院有权撤销仲裁协议，但法院也只是在例外的情况下行使此项权力。
目前，以仲裁方式解决纠纷尤其是商事领域的纠纷，日益成为诉讼外纠纷解决方式中最重要的组成部分。虽然现代仲裁已经失去早期的简单性而变得复杂化、法律化、机构化。但仲裁的实质并未改变，当事人的意愿仍然是仲裁中最重要的因素。尊重当事人的仲裁意愿，倾向于执行仲裁协议的政策在国际范围内已经普遍建立起来。1958年《纽约公约》经过40余年的发展已为世界上绝大多数国家所承认，1985年《示范法》自从颁布以来也被几十个国家和地区所采纳。在国际立法中，赋予反映当事人愿望的仲裁协议以法律效力的观念，已为各国普遍接受，并成为一项规则。就仲裁协议的内容而言，根据大多数国家的立法和实践，当事人只要表明仲裁意图，仲裁条款就是有效的。法院在解释仲裁条款时，对仲裁条款的内容放宽限制，尽量解释其为有效，尊重当事人的仲裁意愿并帮助当事人实现其仲裁意愿，已经成为当今国际仲裁的一大趋势。就仲裁协议的形式而言，由于仲裁协议所具有的妨碍诉讼等程序法上的效力，因而仲裁协议必须具备书面形式也成为国际、国内立法和司法实践所普遍接受的规则。然而仅仅以仲裁协议的形式不符合法律的强制性规范为由，否定仲裁协议的有效性毕竟有违契约自由的基本原则，也极有可能与当事人的仲裁意愿相冲突。为使当事人的意愿在更大的程度上得到尊重，放松对仲裁协议书面形式的严格要求已经成为一种新的趋势。
此外，自20世纪80年代以来，国际商事仲裁发展起了一种全新的理论，即仲裁的“非国内化”理论。该理论主张国际商事仲裁应当排除仲裁程序地国家法律的限制，在认定仲裁协议的效力方面表现为对当事人意愿的完全尊重。虽然该理论存在一定的局限性，也并未被普遍承认。但该理论表现出的对当事人意愿最大限度尊重的理念，仍具有重要的指导意义。与“非国内化”理论相适应，在现代国际商事仲裁实践中出现了直接依据当事人所表达的共同意愿以及公平合理等一般法律原则作为认定仲裁协议效力标准的案件，例如在KhomsEL.Mergebv.Dalico一案中，法国法院认为，仲裁条款受当事人的共同意愿支配，而没有必要依据某一特定国家的法律。从而依据当事人的意愿，确立了仲裁条款的效力。
二、仲裁管辖权优先原则
自1958年《纽约公约》生效以来，支持仲裁的理念逐步在国际上得到确认。《纽约公约》规定：“各缔约国承认仲裁协议的效力”，“对于当事人就诉讼事项订有仲裁协议的，法院受理诉讼时，应依当事一方请求，命当事人提交仲裁”。从而确立了倾向于执行仲裁协议的观念，标志着仲裁管辖权优先的原则在一定程度上建立起来。1985年《示范法》继承并拓展了这一原则。按照该法第8条第2款规定?即使诉讼程序已经提起时，仍然可以开始或继续进行仲裁程序，并可作出裁决。从而使仲裁管辖权优先的原则在《纽约公约》的基础上得到进一步的发展。国内立法中，20世纪80年代中期以来，各国在采纳或参考《示范法》有关规定的基础上，修改本国的仲裁立法，仲裁管辖权优先的原则在很大程度上被各国立法所接受。有些国家例如瑞士1987年《关于国际私法的联邦法》第178条第2款甚至规定：“如果仲裁协议符合当事人所选择的法律或适用与争议事项的法律特别是主合同的准据法或瑞士法律的规定，即在实质上为有效。”这种在数种可以适用于仲裁协议的法律中，只要符合其中之一仲裁协议即为有效的规定，彰显了对仲裁协议的支持态度，使仲裁管辖权优先的原则更易于在实践中被采用。此外，各国仲裁实践中，法院在认定仲裁协议无效、失效或不能执行方面比较谨慎，并不轻易作出这种认定。各国法院在解释仲裁条款时，对仲裁条款的内容尽量放宽限制，尽量解释其为有效，尊重当事人的仲裁意愿，并帮助当事人实现其仲裁意愿成为国际仲裁的一大趋势。而当司法管辖和仲裁管辖发生冲突时，例如对于仲裁实践中经常遇到的当事人既约定仲裁又约定诉讼的仲裁条款的效力问题，各国法院的做法也体现出了仲裁管辖权优先的原则。例如香港高等法院在William Company v. Chu Kong Agency案中认定，提单中的仲裁条款“在中华人民共和国法院解决或在中华人民共和国仲裁解决”是有效的。而新加坡法院在Da Yun Shan案中，面临同样问题困扰的法院虽然认为“该案不是一个一定要通过仲裁解决”的争议，但最终还是通过运用自由裁量权中止了诉讼程序。
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