雅虎目前持有阿里巴巴集团39%股份，阿里巴巴方面表示，集团已向雅虎提出方案，计划回购该批股份的一部分，当中还包括一项把雅虎所持剩余股权价值最大化的详细计划，但雅虎认为方案及报价不寻常和不合理，因此予以拒绝。此后，雅虎向阿里巴巴提出反建议，但集团同样认为不合理而作出拒绝，并终止了双方的有关谈判。
据了解，2005年，雅虎以10亿美元及雅虎中国全部资产，换取阿里巴巴39%股权。当时双方签署一份协议，约定在2010年10月后，雅虎可委任的董事总数将不低于集团管理股东可委任的董事人数，雅虎将在今年10月获得阿里巴巴董事会的第二个席位。
同样自10月起，雅虎的投票权将由35%增至39%，马云等管理层则从35.7%降至31.7%，软银则保持29.3%不变。雅虎在集团董事会势力可能会超过马云等管理层，从而掌握集团主导权，而马云有可能失去对阿里巴巴的控制权。
对此，阿里巴巴回应称，现在对于控制权下结论还太早，两家公司博弈可能还需很长时间。事实上，在股权回购案遭拒后，阿里巴巴要想强制回购股票唯一的可能是联合第三大股东软银。
在雅虎和阿里巴巴2005年签订的协议中，曾有相关条款规定：“阿里巴巴集团首席执行官马云不会被辞退”，但根据当时的约定，这一条款将于今年10月到期。也就是说，届时阿里巴巴集团董事会将有权力决定继续保留或辞退马云目前的CEO管理职位。
在上周召开的阿里巴巴第七届网商大会上，阿里巴巴集团董事局主席马云在与eBay总裁兼CEO约翰。多纳霍对话中，不经意间透露，自己已经老了，期望有继任者来接位，并向多纳霍请教如何做到超越上一辈的期望，并表示如果退休，比较想回学校再做老师。然而业内人士认为，这并不是马云将要离开的暗示。
首先，阿里巴巴集团尚有淘宝和支付宝等业务没有上市，而这两大重要资产何时上市才是雅虎方面真正关心的问题，而在此之前更换掌门人，风险很高；另外，马云在阿里巴巴团队中的地位和声望众所周知，如果马云最终以“条款到期”这种方式离开，难免促成阿里巴巴团队逆反心理。
阿里巴巴内部人士也认为，董事会不会改变马云CEO的地位，因为没有比他更好的人选。
