现金流对于任何一家公司而言的重要性都是毋庸置疑的，过高的应收账款在一定时间内不能回收就会形成坏账，给公司的发展带来很大的危害，甚至破产。南京科远正是因为过高的应收账款让不少投资者感到担忧。
《第一财经日报》记者仔细查阅南京科远的招股意向书发现，在2006年至2008年三年间，南京科远的应收账款分别高达7732.46万元、7047.05万元、9749.22万元，分别占到了当期公司营业收入的62.65%、44.27%、53.32%，占到了公司当期总资产的49.83%、32.68%、38.70%。
而在刚刚过去的2009年度上半年，南京科远的应收账款更是高达11640.44万元，占到了公司当期收入的117.42%，占公司总资产比例也高达40.62%。
对此，南京科远董秘徐长旭在接受本报记者采访时表示，公司2009年上半年应收账款的确比较高，但是据他了解，在年报披露之时这一数据将明显下降。“因为公司已经加大了对应收账款的收取力度。”但是徐长旭以暂不方便为由拒绝向记者透露具体的数据。
按照徐长旭的描述，公司应收账款一直居高不下主要是由两个方面的原因造成的。第一就是公司的主要客户群体火力发电企业近年来经营状况一直不是很好，在付款方面有些延迟。“有些客户都是多年的老客户，关系都很好，因此公司在收取款项时也会更多地信任彼此。”
另外一方面的原因则是公司的付款方式问题。徐长旭称，公司一般采取“181”或“361”的付款方式，即：签署销售合同时先预付10%（或30%），产品经现场调试验收合格后付80%（或60%，余款10%作为质量保证金，在一年的质量保证期结束后付清）；并称这是电力行业支付设备款项时的常用模式。很显然，这样的付款方式对公司现金流的占用将十分严重。但是徐长旭称公司已经就此加强了应收账款的管理工作，并成立了专门的小组。
其实在A股市场上，有很多上市公司包括一些十分优秀的公司都存在客户过于单一的问题，但是只要该客户具有稳定增长性，在相当长时间内并不会影响上市公司的业绩增长。然而这一点在南京科远身上似乎存在变数。
南京科远招股说明书显示，其主要客户为江苏省境内的火力发电企业，2006年、2007年、2008年、2009年1~6月来自江苏省的营业收入占全部营业收入的比例分别为58.38%、61.34%、53.45%、52.75%。显然，公司业务有相对依赖某一市场的风险，一旦相关区域需求减少，对公司的营业收入会产生较大的不利影响。但是在徐长旭看来似乎这一切都不是问题。徐长旭称，电力企业一直都是工业的根本产业基础，在未来相当长时间内公司的客户都不会出现较大的问题，公司自身的业绩增长也是十分确定的。
资料显示，中国十大发电集团2008年所消耗的煤炭造成的环境损失高达870亿。中国火力发电环保模式因此面临质疑。2007年1月，发展改革委、能源办发布了加快关停小火电机组若干意见的通知，要求电厂建设300MW等级以上机组，而之前南京科远的客户多为300MW等级以下机组电厂。在环保问题日益成为社会关心的焦点之时，火力发电厂自身的发展尚未厘清，尤其是那些发电量较小的火力发电厂。
