事实上，创博亚太与腾讯微信的纠纷不仅仅在专利问题上，同时还有“微信”商标的归属问题。尽管微信拥有超过3亿用户，但“微信”商标权目前并不在腾讯手中。
李先生告诉记者，早在2010年11月12日，微信出品之前，创博亚太率先在最重要的3802类别(即时通讯)申请了微信的商标，并开发了创博亚太科技微信系统。据悉，这一微信业务主要是对手机主叫业务进行服务，比如手机上显示来电归属地、主叫方信息业务。但在2011年11月，该公司收到微信商标异议，进入再审阶段。此外，北京联智昭阳文化传播公司提前腾讯一周抢先申请了编号为9060881的“微信”商标，导致了目前38类微信商标呈现“三足鼎立”的状态。
钱先生告诉记者，目前“微信”商标归属问题的最新进展是，已在今年3月份进入“复审阶段”，但复审结果的出炉通常短则几个月，长则超过一年。
长时间的拉锯战对腾讯的损失不言自明。此前上海大邦律师事务所合伙人游云庭曾对媒体称，在争议期间，微信商标基本处于无保护状态，任何竞争对手都可以使用这个商标。他认为，腾讯微信商标申请得太晚，是严重失误，腾讯只能适用未注册的知名商标或者反不正当竞争法进行维权，与注册商标专用权相比，这些条款维权的难度很大。
今年年初，高盛甚至对微信给出了169亿~845亿元的估值。如果“微信”商标失守，腾讯将损失巨大。据悉，目前腾讯更倾向于让国家商标局将“微信”像“微博”那样认定为通用词，这样任何一方都无法拥有“微信”商标，腾讯也可拥有腾讯微信的商标。
而对于创博亚太向腾讯提出索赔金额，钱先生称，目前与腾讯微信的主要矛盾集中在专利纠纷。如果法院最终认定腾讯侵犯创博亚太专利，下一步创博亚太将对该专利的研发投入及损失等方面进行评估后，再向腾讯提出索赔。
