Atropine 化学结构中具有莨菪烷(Tropane)骨架，莨菪烷3α位带有羟基即为莨菪醇。α-羟甲基苯乙酸简称莨菪酸。由(-)-莨菪酸与莨菪醇形成的酯称为(-)-莨菪碱。由于莨菪酸在提取分离过程中极易发生消旋化，所以Atropine是莨菪碱的外消旋体，其抗胆碱活性主要来自S(-)-莨菪碱，虽然S(-)-莨菪碱抗M胆碱作用比消旋的Atropine强2倍，但左旋体的中枢作用比右旋体强8-50倍，毒性更大。临床应用Atropine更安全，而且外消旋体更易制备。
Atropine具有外周及中枢M胆碱受体拮抗作用，但对M1和M2受体缺乏选择性。将Atropine做成季铵盐，因难以通过血脑屏障，而不能进入中枢神经系统，不呈现中枢作用。如溴甲阿托品主要用于胃及十二指肠溃疡、胃酸过多症、胃炎、慢性下痢、痉挛性大肠炎等。
氢溴酸山莨菪碱 Anisodamine Hydrobromide
Anisodamine 是上世纪60年代我国学者从我国特有茄科植物唐古特山莨菪根中提取的生物碱，其氢溴酸盐又称“654”，天然品称“654-1”，人工合成品胃消旋体，称“654-2”。与Atropine的结构比较6位多了1个羟基。
氢溴酸东莨菪碱 Scopolamine Hydrobromide
与Atropine 的结构比较Scopolamine 6，7位多了1个氧桥。
对比上述Atropine、Scopolamine和Anisodamine 等茄科生物碱的化学结构，很容易看出他们的区别只是6，7位氧桥和6位羟基的有无。氧桥和羟基的存在与否，对药物的中枢作用有很大影响。氧桥使分子的亲脂性增大，中枢作用增强。而羟基使分子极性增强，中枢作用减弱。Scopolamine有氧桥，中枢作用最强，对大脑皮层明显抑制，临床作为镇静药，是中药麻醉的主要成分，并且对呼吸中枢有兴奋作用。Atropine 无氧桥，无羟基，仅有兴奋呼吸中枢作用。Anisodamine有6位羟基，中枢作用最弱。
