军事卫生毒理学则脱胎于毒理学，是适应现代军事斗争、和平时期军队建设和国家经济发展的需要应运而生，是军事毒理学和卫生毒理学的交叉融合发展形成的。
由于化学武器在战争中的使用，对参战人员的医学防护成为军事后勤卫生保障的重要研究课题，军事毒理学便由此产生。化学武器大规模使用始于第一次世界大战（WWⅠ）。使用的毒剂有氯气、光气、双光气、氯化苦、二苯氯胂、氢氰酸、芥子气等多达40余种，毒剂用量达12万吨，伤亡人数约130万，占战争伤亡总人数的4.6％。
第二次世界大战全面爆发前，意大利侵略阿比西尼亚时首次使用芥子气和光气，仅在1936年的1～4月间，中毒伤亡即达到1.5万人，占作战伤亡人数的1/3。 医学教.育网搜集整理
第二次世界大战（WWⅡ）期间在欧洲战场，交战双方都加强了化学战的准备，化学武器贮备达到了很高水平。各大国除加速生产和贮备原有毒剂及其弹药外，并加强了新毒剂的研制。其中，取得实质性进展的则是神经性毒剂；在亚洲战场，日本对我国多次使用了化学武器，造成大量人员伤亡。
从WWⅡ结束至今，世界上局部战争和大规模武装冲突不断发生，其中被指控使用化学武器和被证实的有美侵朝战争、美侵越战争、原苏联入侵阿富汗等。80年代初开始的两伊战争，伊拉克在进攻失利、失去主动权的紧急时刻使用化学武器对扭转被动局面、最终实现停火发挥了重要作用。
化学武器是国际公约禁止使用的非常规武器。如1899年和1907年的两次海牙会议，1925年日内瓦议定书以及前不久（1993）联大通过的《全面禁止和彻底消毁化学武器公约》等。我国政府和人民一贯主张禁止使用大规模杀伤性武器，恪守《公约》，为维护世界和平作出了重大贡献。 医.学教育网搜集整理
但是，只要有战争，化学武器的威胁就存在，变相、变种的化学武器也会不断产生。虽然化学武器、核武器禁止使用，美国还是在科索沃战争中使用了贫铀弹。况且霸权主义者、战争狂人也会始终把化学武器当作一种威慑力量。
和平时期，军队的自身建设中也会不断遇到环境因素有害作用的影响，军队还要参加地方经济建设，有许多毒理学的课题有待于攻克。随着经济的发展，面对环境、食品等农药污染，有害因素大量增加；加之，研究手段的提高、相关学科的渗透，人类对生存环境和生存条件的要求提高，卫生学的问题日益突出，卫生毒理学便成为倍受重视的学科。由于自身学科领域的快速发展，卫生毒理学便成为医学门类中不可或缺的独立学科专业，成为国家经济生活、立法、医疗保障、环境改善、提高生活质量的重要学科领域。
