承包商用于垫资的资金中，一部分可能是自有资金，另一部分通常是通过贷款而来。贷款就得承担利息，如果逾期不能还贷，还要承担逾期罚息；而利息、罚息本身就加大了施工企业的负担。如果在一定的时期内国家的金融政策有较大的调整，如大幅度地提高银行贷款利率，则承包人的银行利息及逾期罚息还会加大，从而构成较大的风险。
在垫资施工的情况下，承包商为了能够加快工期进度、或者在至少不延误工期的同时，尽量减少资金投入，常常会通过赊欠材料、设备款的做法来节省前期开支。如此，不但有时会难以保证所购置的材料、设备的质量，而且购买价格亦会与支付现金时有所不同，甚至有时还会出现被追讨材料、设备购置费的诉讼风险。
有时建设单位本身有足够的支付能力，甚至在垫资施工的建设工程已经产生效益（如部分商品房已出售、出租）的情况下，也拒不支付工程款项。承包商碍于已垫付巨额款项，欲停工追债又怕关系搞僵致工程款项更加难讨，从而陷入骑虎难下、投鼠忌器的尴尬境地。特别是，如果建设工程建成之后施工人仍未能收回工程款，会面对银行、材料商、设备商、施工工人及其他债权人的强大压力。为了解决债务的困扰，施工单位有时不得不违心满足建设单位的若干不合理的要求。
即便是经营状况好的建设单位，一般也是先考虑再次进行项目开发的用款，而对拖欠的工程款采取尽量回避、拖延的态度；如果一旦经营、销售不顺，更会以各种借口拒付、拖欠或克扣工程款项，从而给承包商带来巨大风险。
一般地说，承包商拖欠劳务费的现象比较多见，短期的拖欠也能够被劳务人员理解与接受。但如果承包商因种种原因长期无力支付劳务费用，那么面临停工、追讨、涉诉的风险也是很现实的。
在垫资施工的情况下，承包商赊欠材料、设备购置费、拖欠人工费的做法已属常见现象。但如果市场行情在一定的时期内有较大的变化，如材料、设备购置费或人工工资有较大的上涨，就会为承包商带来很大的额外负担。
