是否进行公司股东名册变更登记与工商变更登记，影响的是股东能否取得股东权和转让行为能否对抗善意第三人，并不影响股权转让合同的效力。股东名册变更登记属于设权性登记，标志着受让人取得股权。而工商变更登记属于宣示性登记，是对已经得到履行的股权转让合同予以公示。
股权转让合同生效之后，当事人应当通知公司变更股东名册和办理工商变更登记。如果公司拒绝办理股东名册变更登记，意味着受让人没有取得股东地位，受让人可以主张合同履行不能，追究转让人的违约责任。如果公司拒绝或者怠于办理工商变更登记，转让人和受让人均可要求公司办理，并追究公司侵权责任。
当事人经常发生误解，在合同生效之后，认为股权就当然转让，受让人就已经成为公司的股东。但实际上，合同的生效只是确定了当事人转让股权的权利和义务，股权的实际转让和股东资格的继受仍需要当事人的履约行为。在股权转让合同生效后，当事人可能依约履行，将股权交付受让方，也可能一方或双方违反合同而拒不交付股权或拒绝接受。在这种情况下，股权的转让就处于合同生效而未实际履行的状态，受让方享有的只是股权交付和违约赔偿的请求权。而只有股权实际交付后，受让方才能取得公司的股东资格。由于股权是无形财产，不可能象有体物一样进行物理形态的移转，其交付转让与有体物的交付转让不同。
所以，公司股东名册的记载才是股权取得的标志。有限责任公司股东名册的登记是设权性登记，未经登记，是不能产生创设权利或法律关系的效力。一份有效的股权转让合同是股权转让的基础，没有这份具备法律效力的合同，就没有要求变更登记的依据，基于这份股权转让合同，当事人有权根据《公司法》第74条规定，要求公司进行股东名册变更。股权的取得是股权转让合同行为与公司变更登记行为共同作用的结果。但是，根据工商登记行政管理的要求，公司还需要去工商登记机关办理变更登记，但这也是向社会公示的过程。
需要注意的是，我国公司法律制度创建时间不长，股东对公司法重视不够，有限责任公司股东名册的管理、变更并不规范，甚至很多公司并不设置股东名册。因此，审判实践中应根据实际情况，扩大对“股东名册”的解释，只要有关的公司文件，如公司章程、会议纪要等能够证明公司对股东的认可的，就应认定设权程序已经完成，公司接纳了新股东。
