1、中小企业资本金严重不足，资产负债率很高。一旦资金链条断裂或脆弱，企业的生产经营活动会受到沉重打击。中小企业与大型企业相比具有初始资本投入不足的特征。企业创立时的初始资本投入，主要取决于发起人的资本力量和所规划的事业规模。一般而言，中小企业主要适于从事于大企业的配套协作生产或服务业等对规模要求不高的生产经营，因而其初始资本不会很大。在我国，中小企业在改革开放之前多为地方国有企业和城镇集体企业。改革开放之后，随着市场经济的逐步成熟，又大量涌现出各种类型的中小企业，其企业所有制形式也变得多样化，有集体企业、联营企业、私营企业、有限责任公司、股份有限公司、股份合作企业、港澳台商投资企业、外商投资企业和其他企业等。地方财力的分散性、乡镇财力的有限性、民营经济发展初期资本原始积累的不足，以及20世纪八十年代及九十年代初期所吸引外商投资的结构特征，都决定了我国的中小企业在创办之初的资本投入是不够充足的，即资本金不足。
2、财务制度不健全。由于绝大多数中小企业处于依靠创新成长、依靠指导成长阶段，未能形成一套科学的、制度化的管理体制，因而与大型企业相比，中小企业在财务管理上普遍存在着下列问题：缺乏严密的资金使用计划，资本周转效率较低；在存货管理和债权债务等方面缺乏必要的内部控制，随意性较强；缺乏健全的财务管理体系及制度，不具备大企业那种内部资金调度能力；不注重吸收外源投资，而将运营资金盲目用于固定资产投资；重视利润而忽视现金流量的管理，消费过高而导致积累不够。这些问题导致了财务管理的乏力，进而加剧了企业融资的困难。
3、技术水平低，人员素质有待提高。我国目前中小企业普遍技术水平不高，对科技活动的支持力度小，地区分布不均衡。据江苏省统计局发布的《江苏省第一次全国经济普查主要数据公报（第二号）》显示，2004年末在江苏规模以上工业法人企业中开展科技活动的有5，454个，占13.35%。在大中型企业中，开展科技活动的企业所占比重为49.70%，小型企业中开展科技活动的占10.31%。在开展科技活动的企业中，苏南、苏中、苏北地区分别占63.15%、25.01%和11.84%，企业科技活动主要集中于苏南地区。
制造设备情况反映企业的工程化能力。根据2004年浙江省对中小企业技术创新能力调查结果显示，57.8%的企业装备水平达到国内先进水平，30.6％的企业装备水平达到国际先进水平，11.6%的企业装备水平达到省内先进水平。从这个指标看，浙江省科技型中小企业走在了全国的前头，但与发达国家相比仍需加强。
就学历水平而言，我国中小企业员工的学历水平普遍偏低。《中小企业发展问题研究》课题组以2004年度我国全部中小工业企业，共计273，263家为样本进行了评估，并发表了《2005年中国成长型中小企业发展报告》。本次调查在考察中小企业员工素质问题时，调查了企业员工的受教育时间。调查结果显示，我国中小企业员工的受教育时间平均仅为11.89年，大体相当于高中教育水平。高中及以下员工比例占了全部企业员工总数的3/4，其中初中及以下员工比例为31.61%，高中教育水平员工比例为44.43%，大专为14.84%，本科为8.15%，研究生以上为0.97%。上述状况表明，我国中小企业员工的文化素质普遍偏低。当然，中小企业员工素质的这种构成与中小企业自身特点和自身发展阶段有着密切联系，一些劳动密集型企业甚至不需要多高的劳动技能，但从长远发展来看，企业员工的基本素质则是决定企业成长的关键因素之一。
