第一，在投票权上，债权与股权不同。企业筹措资本在股权和债务之间选择，就是决定控制权在股东与债权人之间的分配。在企业持续经营的情况下，股权在企业决策中起主导作用，债权不参与企业决策。但在企业持续经营受到威胁的情况下，股权的主导作用就要让位于债权，尤其是当企业出现清偿违约及不能支付到期债务时，债权人将接管股东对企业的决策权。股东为避免让渡决策权，确保自己的剩余索取权不向债权人转移，将努力在企业融资安排及投资决策上尽可能保守。当然，这种约束或风险对不同的企业来说，意义不同。对我国绝大多数上市公司来说，负债融资与股权融资的区别这方面的风险几乎是不存在的。
第二，在收益权上，债权人的索取权为企业的固定收益，而股权则为剩余索取权，这对企业的决策行为有着重大的影响。股东为使自己的剩余索取权最大化，将尽可能进行有风险的投资，因为风险投资如果成功，巨大的剩余索取权将为股东所独享，而万一失败，债权人将承担后果。这一点，使得股票和债券的收益性和风险性产生了很大的区别。根据风险与预期收益正相关的理论，股票投资为高风险高收益，而债券投资则低风险低收益。这是投资者对股票与债券的观点。融资企业的看法正好相反。
第三，在现金流动性上，负债融资与股权融资的区别在企业延续期间，本金无须偿还，不会对企业的现金流量产生压力，而债权融资则有偿还的期限约定，到期不能偿还，企业将因违约被清偿。因此，对企业现金流动性、资产流动性有较大的压力。不过，由于长期融资的金融创新，较长期限（如30年）的长期融资对企业的流动性的压力上基本上等同于股权。此外，在现代资本市场上，股权也常常面临续回的压力（在股价表现不佳时，股东常常要求上市公司回购自己的股份，以维持股价），因此，两者在这方面的差异也在缩小。
第四，在清算顺序上，一旦企业因违约事破产进入清算，债权人优先于股东获得清偿。但这一权力的使用常常会受到限制。原因有两点，一是在债权人之前，往往还有更优序的偿还者，主要是企业职工和政府，在偿还债权人之前，必须优先保证对员工的工资及养老金等其它福利的清偿，以及保证对政府拖欠的税收等的清偿，这之后，才清偿债权人的债务。因此债权人债务的清偿往往也得不到保证。另一方面，进入清偿或破产的企业往往资不抵债，亏损严重，可变现资产及资产价值本身也已所剩无几。
第五，在融资成本上，债务融资支付的利息可以在企业税前支付，而股权的红利则在税后支付，因此，债务融资有所谓的税盾（taxsheld）优势。但企业存在的大量的非债务税盾，如折旧费用、研究开发费用、广告费用等，会冲淡债权融资的这一优势。此外，一些新的融资工具的出现，正在日益消除债务与股权之间的差异，如可转换债券，就兼具股权与债权的特点，一定情况下，债权可以转化为股权。
第六，在我国当前的证券监管体制与资本市场价值估价习惯中，债权融资有一个突出的好处是，发行长期债不会摊薄每股收益。而每股收益是市场评价上市公司股价的一个重要依据，也是证券监管部门审批上市公司配股、增发新股票的重要依据。因此，为了在资本市场上保持一个好的形象，许多企业选择发行可转换债券这样一种两者优点兼具的融资工具。
事实上，除了股权与债权之间有明显的区别外，不同的负债之间也有所区别。首先负债有期限上的差异，这对企业的现金流动性的影响是不言而语的。其次，不同的债权在清偿顺序上也是有差异的。负债中，具有担保或抵押的负债具有优先索取权，没有担保的负债中，银行的债权优先于公开发行的债券。由于存在这样的偿债顺序，企业负债时，往往先通过担保或抵押进行负债（这也是债权人在理性预期下对企业的必然要求为避免被后来的债权人剥夺，最初的债权人总是会要求企业提供负债的担保或抵押品），这样的债权的偿还性要好一些。在没有担保品或抵押品后，企业如需继续负债，则必须支付更高的成本即利息。随着企业负债量越来越大，负债率越来越高，企业所支付的利息率也越来越高，这是债权人要求的对其不断增加的风险的补偿。这样，负债的增加必然增加负债的成本。
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