一是缺乏针对性：据了解，不少学校都喜欢在两个学期的开学前安排半天或一天的校本培训，然后在开学后再安排两到三次次就算了。至于培训的内容方面却很少考虑是否有针对性，对培训的目的往往不够明确，很少与学校的教科研工作或课堂教学改革方面的内容结合起来，往往是一些大而空的培训。所以，有时候老师们好像只是应付式或任务式的培训。长此以往，老师也只好带着一种被培训的心态去参加，反正心里想着拿点继续教育的学分就是了。显然，这样的校本培训是达不到预期目的的。
建议：校本培训必须加强针对性，根据学校与教师发展的需要而规划具体的培训内容。缺什么就培训什么，什么最紧迫的就先培训什么。培训内容不在乎多，与其务虚不如求实，要充分体现其必要性和针对性。对于学校来说，最重要的还是要加强对一线老师的培训，尤其是与教师课堂教学密切相关的培训。
二是缺乏系统性：由于培训部门对校本教研缺乏系统的思考，因而在培训内容方面往往缺乏系统性，培训专题之间缺乏连贯性，所以往往是一次性的培训。对培训的主题未能得到进一步的拓展和深化，只是停留在一种一知半解的状态或似懂非懂的感觉。当下一次培训时，基本上就忘记了上一次的培训内容了。
建议：校本培训要体现系统性，系统规划，系统培训。从宏观到微观，从理论到实践，从认识到操作。通常来说，一个主题的培训要通过系列的培训才能真正完成，一次性的培训是不透彻的，所以效果也是不明显的。
三是缺乏层次性：校本培训通常是全员性的一种培训，无论是什么培训都要求全体老师参加。作为一所学校来说，不同层次的老师是需要不同层次培训的。但由于缺乏全盘考虑，往往停留在通识培训这一层面。由于缺乏层次性，所以老师感觉收获不大，自然就慢慢地失去了参加培训的兴趣和热情。
建议：校本培训要关注层次性，根据不同层次老师的需要安排不同的培训。一是要考虑不同层次的对象(如：新教师、青年教师、骨干教师等)，二是要考虑不同层次的内容(如：教学技能、教学策略、课题研究等)，三是要考虑安排不同层次的主讲老师来培训(如：校级、区级、市级、省级等)。
四是缺乏实践性性：不少校本培训都仅仅停留在理论层面的学习和认识，但往往缺乏如何将理论与实践结合起来的操作性指导，这种理论与实践脱节的培训往往让老师觉得没有多大意义。为此，培训结束后培训的内容便成为空中楼阁，未能让老师真正感受到培训的价值所在。
建议：校本培训的根本目的在于转变观念和指导课堂实践，培训学习最终要体现在教学行为的落实上。理论培训固然重要，但通过实践来检验理论的可行性则更为重要。实际上，现在老师缺的不一定是理论或理念，而是如何将先进的理论或理念与课堂教学实践融合在一起的操作指南，也就是说最缺的是具体操作的路径、程序以及方法。为此，培训者必须在操作层面上为一线老师提供切实可行、行之有效的操作培训。
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