（1）脑皮质发育不全 ①脑回增宽大脑皮质纹理简单脑沟减少脑回增宽。皮质结构常仅有4层。②脑回狭小一部分皮质纹理复杂，脑沟增多、变浅皮质呈现散在硬结神经细胞大小不均、树突减少。③脑叶萎缩性硬化局部或弥散性脑回萎缩、变硬神经元变性，胶质细胞增生。④神经细胞异位胚胎期神经细胞迁移过程失常，发生神经细胞异位白质中出现未成熟神经细胞或者外观正常而镜检可见神经细胞数目稀疏排列不齐，胶质纤维增加。
（2）先天性脑穿通畸形 为局部皮质的发育缺陷，脑室向表面开放如漏斗，斗壁为带有软脑膜的皮质。常双侧对称地发生。
（3）先天性脑缺失性脑积水症 为发育过程中大脑的囊性变性，颅腔内大脑两半球完全或大部缺失，亦可一侧或双侧单一的脑叶缺失，如颞叶缺失，其所居部位代以蛛网膜囊，囊内充满脑脊液。颅骨及脑干发育正常但由于囊肿长期搏动压迫局部颅骨可变薄变形。患儿头大，前、后囟及骨缝增宽多昏睡，吸吮、吞咽功能不良。透光试验可见囊肿区透光阳性。
（4）无脑畸形 为大脑完全缺如且头皮、颅盖骨也缺失，仅有基底核等由纤维结缔组织覆盖，出生后婴儿无法生存，不久即死亡。
（5）巨脑畸形 表现头大，脑体积对称性增大，神经元数目大小增加，但脑室相应狭小常伴智能障碍。
（6）胼胝体发育不全 胼胝体完全或部分缺失常伴有其他畸形如脑积水、小头畸形及颅内先天性脂肪瘤等。临床上可不出现症状可表现为癫痫及（或）智能发育不全。气脑造影可见侧脑室前角间距离明显增宽第三脑室扩大。
（7）先天性双侧手足徐动症又称Vogt综合征 病理特征为镜检下见双侧壳核及冠状核髓鞘纤维增加，神经细胞减少和胶质增生，称大理石样状态。偶尔为基底核纤维发育不全，则称为髓鞘不全状态。病因可能为胎儿发育障碍、产伤或新生儿窒息。患儿发育迟缓，肌张力强直，出生数周至数月后逐渐出现身体各部位缓慢蠕动的不自主动作，四肢末端比较明显，也常有构音呐吃和吞咽困难，少数患儿表现为舞蹈样动作、扭转痉挛肌阵挛性动作、震颤或单纯的肌张力强直。本症可与脑性瘫痪和智能发育不全并存，并可进行性加剧立体定向手术可能减轻症状。
