由于政治权势的扩展，医学中心也随之而转移到意大利的波隆那（Bologna） 与帕度（Padua），法国的巴黎与蒙培利尔（Montpellier），英国的牛津（Oxford）与剑桥（Cambridge） 等大学。公元一二四○年，皇帝弗瑞德烈克 Friedrich 二世，颁布法令，以解剖学为医师必修科目，于是才有公元一三一六年，孟狄诺 Mondino （1275-1325） 的“解剖学 Anatomia ”问世，虽然它只是一本指导解剖技术的书，而不是对人体解剖的研究。此书曾经四十版的再版发行，成为维萨留斯 Vesalius 诞生前的标准教科书。
欧洲医学的发达一直到十五、十六世纪方露署光，因为经过文艺复兴之后，一切学术都活泼起来，人文主义逐渐抬头，出世的人生观渐为入世的人生观所取代。哲学方面出现自由的真理研究之顷向，法国的笛卡儿Descartes 主张唯理论，强调实验的重要性；培根Bacon 主倡经验论，提出“归纳法”以补“演绎法”之不足，到了德国的康德 Kant，方综合大成，树立近世哲学的新体系。科学方面，波兰人哥白尼 Copernicus 确立了太阳为宇宙之中心的学说；德国人克卜勒Kepler 提出行星依椭圆轨道绕太阳运行的学说；英国人牛顿发现万有引力之大法则。哥伦布发现新大陆和印刷术的发明都是这时期的重大发现。
谨慎的观察，自主的研究和以自然法则为依归的趋势是近世医学所以逐渐兴盛的原因。艺术家达文西Leonardo da Vinci （1452-1519） 对人体结构及功能做了一系列的素描 和笔记，而使艺术和解剖学相结合。事实上，达文西是最早怀疑葛伦的人，他对心脏、血管所做的研究，获得与葛伦不同的结论。他发现瓣膜只许血液向一侧流动，可惜没进一步的阐释。
现代医学可说是始于公元一五四三年，在这年，28岁的伟沙流斯 Andreas Vesalius （1514-1565）出版第一部完整的人体解剖学教本：“人体解剖学”。在整个医学史上，这是最有意义，也可说是最美丽的一部教科书。他推翻了传统的葛伦的缪说，这是因为葛伦的叙述只是根据低等动物如猿猴、山羊等的解剖所致。伟氏的解剖学逐渐地成为所有医学的基础。
在十六世纪尚有几位著名的医师值得一提，如帕拉西塞斯 Paracelsus（1493-1541），他公然的反对当时食古不化的医师对希摸克拉底、葛伦的一厢情愿地依附，这种反抗权威，藐视传统的态度和提倡在实验的基础上不断地创新，可说是医学革命的先驱。帕氏是倡导医学应以广泛的自然知识为根据的第一人，认为人体是综合所有外界的自然法则的形相，乃对应大宇宙而形成的小宇宙。意大利的法拉卡斯托洛 Girolamo Fracastoro（1484 -1553）可说是最早的流行病学家。公元一五四六年他出版了《传染病论》一书，提出由接触和空气而传染，排斥葛伦的体液腐败发热说。在显微镜尚未发明的时代，他的理论可说相当精确。公元一五三○年，他又出版了一套谈论梅毒的书，共三册，包括有名的梅毒诗， Syphilis 一词便是从这首诗来的，原来病人的名字叫做 Sypylus，乃是一位牧猪人。
当十六世纪结束后，人们的思想又随着新世纪的到来而有了极大的转变，特别是意大利帕度亚大学，在伟沙流斯辛苦的播下种子后，逐渐地开花结果，首先是哥伦博 Realdo Colombo 成功地证明出血液由心脏流到肺脏，然后，再由肺脏流回心脏。其后的法洛比欧 Gabriel Fallopio 发现女性输卵管，并以其名命之。当法布里邱 Girolamo Fabrizio 接任时曾发现了静脉瓣，最后在他的学生中出现了极一位优异的人才，名叫威廉哈维 Willian Harvey （1578-1658），他是英国人，由剑桥大学的Caius 学院毕业后，即迫不及待地到帕度亚大学深造，公元一六○年获得帕度亚大学的医学博士学位。帕度亚的训练，使哈维迷上了解剖学，并主倡由直接观察与实验证明来解决动态的观念-脉搏与呼吸。在哈维时代，葛伦的解剖学观念仍然深植人心。葛伦认为消化过的食物在肝脏中被精制成血液，然后，经由血管以一种神秘的来回运动方式运行全身。在此种运行中，有部份血液流入右心脏，然后，经由中膈的小洞而流入左心脏再到其它器官。同时他又声称，心脏的血液流至肺脏，这些空气可使血液散热并保持一定温度，同时也提供了血液所需的“生命力”以控制其生体功能。
葛伦的理论令哈维发生困扰的是：每次心跳所排出大量的血 液究竟从何处产生？从食物而来？或由继续不断的制造产生？哈维假设心收缩时每次排出血量为二英两，那么一个人要是每分钟心跳七十二次，则每小时排出八六四○英两。每小时要制造这么多血液似乎是不可能的事，因此唯一合于逻辑的推论是：喷出的血必然是经由某些血管，再被送回心脏，那么运回血液的血管就只有静脉了。接下来须待证明的就是剩“静脉血是否永远流向心脏”这问题。他在帕度亚大学时的老师法布里欧 Fabrizio 所发现的静脉瓣正好派上用场，哈维做了一个简单的实验与观察就解决了这个问题：他用一根棒子用力往下挤压手上的静脉，发现静脉瓣的排列方式，使血液几乎不可能往末端流动。就这样哈维发现了人体血液循环的秘密，推翻了支配千余年的葛伦等的主张，认为血液是在血管密闭系统内循环，而心脏中隔也没什么小洞而是经肺的小循环吸收空气后再回流入心脏，最后再循环全身。一六二八年，他将这些观点发表于《有关心脏运动》一书中。哈维有关血液循环的理论存在着一个明显的漏洞，即血液到底是如何从动脉流到静脉。这个漏洞一直要到显微镜问世后方得以弥补。
显微镜可说是医学和一般科学发展中，最重要的发现。古代人们已知用磨过的镜片做为放大镜，而眼镜在中世纪就已制造出来了。荷兰的一个制造商，约翰逊Zacharias Janssen曾试着把数个镜片加以组合，来增加放大率。第一篇利用显微镜写的论文是史泰路提 Francisco Stelluti 在公元一六二五年所完成，内容是研究蜂蜜的结构。那时的显微镜都很粗糙且倍数不超过十倍，直到荷兰的雷？文霍克 Anthony von Leuwenhook （1632-1723）才制造出一台放大二百七十倍的显微镜。雷氏本是布商，没进过大学，但对显微镜的爱好已到了疯狂，他是第一个认出血球的人（马尔匹吉误认血球为“脂肪小球”） 并对精子做了仔细的研究，同时也注意到骨骼肌有横纹的外观。
公元一六六一年，意大利的解剖家马色罗？马尔匹吉 Marcello Malpighi （1628- 1694） 在观察青蛙的肺脏和肠系膜后，终于发现末稍动脉和静脉乃是由一种直径像头发一样细微的血管网所衔接，而将之命名为毛细血管 Capillaries，如此添补了哈维理论的漏洞，血液循环论因而大功告成。同时他也因而获得“显微医学之父”的美名。
U174119820
U881338364
