①药材品种必须鉴定保证质量。因为中药同名异物，同物异名的现象普遍，一种药物也常有数个品种，质量差异很大，这类问题不解决，就无法进行分析研究。
②注意药物的提取方法及实验动物种属、剂量、用药方法、给药时间及温度等客观条件。由于提取方法的不同，所含成分差异很大。在不同时期、时间、温度下给药可能产生相反的结果，尤其是对温、补、清、泻及理气理血等类中药更应注意。
③剂型不同，作用也有区别。复方多数是汤剂，成药有丸散膏丹，剂型虽多样，但大多数口服；一经提取，除口服外，还要在动物身上多种途径给药，结果会出现一些新情况，发现一些新问题，甚至得出一些与传统经验相互矛盾的绪果，致使研究报告不能符合中医临床的要求，所以剂型要固定，制剂要稳定。
④动物模型与中医辨证力求符合或近似。复方研究中用的病理模型很重要，在临床上治疗某证的复方，在动物实验时却以平常动物为实验对象，不但存在种属及个体差异，而且存在生理病理区别，如何模拟人类复杂病情，制造适合复方研究要求的多样化病理模型，目前还存在一定困难。
⑤复方药理研究结果的重现性不够强，所以在研究时客观条件要稳定，总医|学教育网搜集整理结前要反复实践，使重现性加强，力求结果准确可靠。
复方的药理研究很必要，但在目前还是一个薄弱环节，建议今后应从以下几个方面努力改进：药理学工作者必须克服对复方研究时存在的难以下手的情绪。即使研究一张组成复杂的复方耗时费力，也要勇于承担任务，克服困难。
中药成分相当复杂，复方的有效成分分析和提取，困难更多，希望植化工作者与药理工作者加强协作。
复方中的古方有加减法，今方有基本方，也有随证加减。在研究时，希望处方要相对固定下来，非不得已，不轻易改变处方，一经变化处方，会给实验研究带来很大损失。
复方组成和主治功能本身存在问题。如组成复方的多味药，有的是对因治疗，有的是对症治疗，因为治疗范围广，显示它的多效性，到底主治哪项是主要，会随病人病情随时变易，所以适应证罗列得很多，使药理研究者难以抓住重点予以突破，建议选方或制方时，取药味精简，疗效显著，以便制定研究指标。以上存在的一些问题，相信通过不断的努力，会逐步解决。
