月经周期的调节，是以肾一天癸一冲任一胞宫之间的平衡为理论基础，一旦这种平衡失常就会导致月经失调等疾病。又由于月经的产生是以肾为主导，故“补肾”就成为调整月经周期的基本核心。现按月经后期一月经中期一月经前期一月经期的顺序为一个月经周期（月经生理），临床治疗则相应依序为益肾补血一补肾活血一补肾调冲一和营调经的治疗方法。
中医周期治疗就是在上述月经生理的基础理论指导下，综合运用脏腑、气血、冲任和阴阳学说的一种新治法。
月经后期（第6～10天）相当卵泡发育期。此期经血刚净，胞宫精血刚泻完，血海空虚，子宫内膜已剥落，刚进入增生期，基础体温呈低相，属肾阴（精）不足时期，需通过药物来补充、调节脏腑、气血和经络的功能，促使冲任精血逐渐充盈，注于胞宫以藏精气（血），修复子宫内膜。经本于肾，天癸源于肾，肾中之阴精又是月经的物质基础，故此期治疗以滋养肾阴，培补气血，充盈血海为根本，方如促卵泡汤（生地、熟地、党参、当归、白芍、首乌、菟丝子、肉苁蓉）等。
絪缊期（第11～14天）又称月经中期，此期卵泡已发育成熟到排卵，子宫内膜高度增生，基础体温由低相转化为高相。此期冲任精血充盈，胞宫精血渐渐满藏，趋于阴转阳的阴阳转化时期，是最易受孕的絪缊期。此期治疗除了继续培补肾精外，尚需加入活血调气药，以疏通冲任气血，协助冲任气血施化和阴阳转化，促进排卵。方如促排卵汤（当归、川芎、赤芍、红花、熟地、仙灵脾、巴戟天、菟丝子、黄芪、香附）等。
此期黄体发育成熟，子宫内膜由增生期转化为分泌期，基础体温出现高相，体现由阴盛已转向阳长的时期，此期肾气旺盛冲任精血盈满，注于胞宫，胞宫处于精血满而待泻的阳气活动旺盛的时期。治疗宜温肾助阳为主，佐以养精滋阴之药，以阴助阳，阳中求阴，促进黄体发育健全。方如促黄体汤（当归、熟地、制首乌、川断、肉苁蓉、菟丝子、黄芪）等。
月经前期（第25～28天）和月经期（第1～5天）相当于黄体退化到子宫内膜剥落期。此期冲任精血蓄注胞宫满而将溢，胞宫行司泻的功能，于是经血下行，化为月经，机体由阳弱转入阴生的时期，治疗宜顺应胞宫泻精转经的作用，以通为用，可用活血理气调经之法，促使子宫内膜剥落完全，并较快排出，经血能下行通畅，为建立下一个月经周期作准备，方如和营调经汤（当归、川芎、赤芍、熟地、香附、乌药、益母草）或桃红四物汤加减等。此期应结合基础体温进行治疗，如患者基础体温在排卵后上升持续12～14天以上，应结合病史和症状，是否有怀孕可能。
