儿童牙科的发展史表明其发展和形成与学校牙科、口腔内科有密切的关系。早在1883年比利时就开设了学校牙科诊所，从事儿童牙科的临床工作。英国在1885年配置学校牙科医生，l931年挪威奥斯陆大学(Oslo University)开设独立的儿童牙科教研室，l951年北欧成立儿童牙科学会。欧洲的儿童牙科多以学校牙科诊疗为起步而发展起来的，也为当今的儿童口腔医学奠定了基础。
美国初期也是以学校牙科为中心开展儿童牙科的工作，其学校牙科除以治疗工作为主以外，医-学-教-育-网搜集整理又渐渐重视口腔卫生教育工作，1912年在美国成立了国家口腔卫生协会(National Mouth Hygiene Association)。美国的儿童牙科不仅由学校牙科延伸而来，还与其福利慈善事业的兴起有关，把对贫穷儿童所作的牙科治疗工作称之为Operative Dentistry for Children，这也是美国儿童牙科早期的最简单的形式。l918年美国西北大学(North-West University)将儿童牙医学作为一门独立的学科列入牙医学的教学内容。
日本的儿童牙科起步迟于欧美，l927年在日本大学齿科内设有儿童科，是临床儿童牙科形成的开端。1956年在日本的齿科大学内正式列入了儿童牙医学的教学内容，1963年日本小儿齿科学会成立，日本的儿童牙医学是在第二次世界大战后、经济得以恢复上升后较快发展起来的。在目前日本的29所齿科大学或大学的齿学部内均设有儿童牙医学教研室，而日本儿童牙科及儿童牙医学教研室大都是由相当于我国口腔内科的“保存科”及其教研室中分离、独立而发展的。
我国儿童牙科的部分工作虽随成人牙科工作的开展而早有所存在，但就此学科的确立、进展及被重视度是远远迟于后者。20世纪40年代由王巧璋、李宏毅和方连珍等在四川省成都市和上海市分别从事单独的儿童牙科诊室的诊治工作，这可谓我国儿童牙科的雏形。新中国成立后，在20世纪50年代我国儿童牙病的防治工作受到重视和关心。上海市自1958年起建立了自上而下的学校口腔医-学-教-育-网搜集整理保健网，以上海市牙病防治所为主，协同各区牙病防治所及个别医院的口腔科开展儿童口腔保健工作，对幼儿园和小学的儿童定期检查和防治牙病。保健网络中之儿童，以极为低廉的费用即可享有每年一次的口腔检查及对龋病、牙髓病、根尖周病、牙龈炎等疾病的治疗。除此，还开展对儿童的口腔卫生宣传教育和一些简易的预防措施。
20世纪80年代以来，随着经济发展及国内外学术交流之展开，我国儿童口腔医学的发展较快。一些口腔内科设立了儿童治疗室，有的继而发展为独立的临床科室。某些口腔医学院内已设有独立的教研室，个别甚至建立了儿童口腔医学研究所。临床范围和教学内容在广度和深度上正日趋完善。我国的儿童牙科也是主要从口腔内科中分离独立而成的，也和儿童口腔保健工作的开展有关。1987年11月在北京召开了首届中国儿童口腔疾病防治学术会议，随之在中华医学会口腔医学分会成立了儿科学组。继而在上海、西安、武汉和北京又相继举办全国儿童口腔医学的第2、3、4、5次学术会议，2000年11月又在上海召开了第二届亚洲儿童口腔医学学术会议，11个国家和地区、跨国内30个省和直辖市的近500名学者出席会议，交流学术、探讨该学科的发展。1997年、2002年和2004年，我国的儿童口腔医学专业人员先后组团赴日本、韩国和泰国，参加本专业在亚洲地区的大型国际学术会议，作为参会的主要代表团发挥作用，扩大影响。2007年6月，85名作为中国儿童口腔医学界的代表，出席了在香港举办的“第21届国际儿童牙科学会大会”，是来自51个国家和地区的代表团中最大的代表团。随着中华口腔医学会的成市，l998年10月原儿科学组改组为中华口腔医学会儿童口腔医学专业委员会。
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