大概有10%的复发性口腔溃疡与系统性疾病相关联，口腔溃疡只是这些疾病的一种表现，如白塞病、克隆病以及一些传染性疾病等，都会有口腔溃疡的表现。这就不仅仅是口腔科可以控制的问题，患者首先应积极治疗原发病。
很多人认为吃维生素B2就可以治好口腔溃疡，复发性口腔溃疡需要进行规范治疗，仅补充维生素B2不一定有效。
对于不同程度的口腔溃疡，应有针性对地采取不同的治疗措施。对于一两个月发作一次、溃疡个数少、7～10天可自行愈合的轻度溃疡患者，建议局部用药，保证充足的睡眠，多通过食物来补充维生素，保持口腔卫生。
如果溃疡复发频繁，此起彼伏医学`教育网搜集整理，溃疡数目较多，甚至合并身体的其他症状，如关节酸痛、腹泻、皮肤红疹、多发性球结膜炎等，这类患者应到口腔专科医院黏膜病专科就诊，做一些相关检查，找出原因后，进行免疫调节等对症治疗。
进行免疫调节时，很多患者会抗拒服用激素类药物，害怕激素会产生副作用，但罗主任说，口腔科激素用量少，患者在治疗时要谨遵医嘱，不要擅自停药。
对于女性患者，如果口腔溃疡经常在经前规律地出现，应检查一下体内性激素水平，然后在医生指导下使用药物调整性激素水平，可使病情得到改善。
很多患者担心口腔溃疡经常发作会导致癌变，不少患者是因为恐慌来就医的。罗刚主任明确指出，复发性口腔溃疡只是一种周期性发作的慢性病，一般7-10天可自愈。只要是能自愈的溃疡就不会发生癌变，患者没必要过于紧张。但他同时提醒，部分口腔癌癌前病变也可表现为溃疡，对于位置固定且超过一个月无法自愈的溃疡则要高度警惕，及时到医院确诊，以免延误了病情。
