一般表现为脑膜脑炎、脑干脑炎、急性无菌性脑膜炎、周围神经炎等的神经系统症状其实并不常发生，因为神经系统极少被累及。在脑脊液中不仅可以看到异常淋巴细胞，而且还可以看到中等度蛋白质和淋巴细胞增多。虽然发病时挺可怕的，不过其预后很不错，即使是重危者痊愈后也多不留后遗症。
除了比较少病例会持续几个月，甚至成为慢性活动性EB 病毒感染，一般的病例多数在1～3周即可复原。但是此病有可能会复发，复发病情持续时间不会那么长，一般是较短，病情也轻。
在对本病进行诊断时，必须提高对本病的警惕，因为本病的临床表现有时变化多端，以防漏诊或误诊。
可以根据以下症状和检查确诊为传染性单核细胞增多症：急性起病、咽峡炎、淋巴结肿大、发热，外周血异型淋巴细胞增多（>10%），并且嗜异性凝集试验阳性。若要确诊为EBV引起的IM，则得对进行EBV特异性血清学检查，如果动态观察IgG抗体滴度明显上升或出现EBV的IgM抗体阳性，则可确诊。
要重视临床体格检查，创刊细观察详细症状，因为很多种疾病的症状类似，例如很多疾病就有发热伴淋巴结肿大，及肝脾肿大，但是并不能以此来为定其患有传染性单核细胞增多症。如果临床上发现咽部有咽峡炎明显，则应该再做进一步检查，很大可能是IM.如果咽峡炎突出，则很有可能是伴多脏器损害的IM，但是其临床表现更为复杂，诊断难度更大，并不能以此就断定。
诊断的重要手段之一是血清HA的检出，尤其是短期内效价明显升高者，对IM具相对的特异性；各种EBV抗体的检测例如VCAIgM的检出对困难病例有鉴别价值，VCAIgG效价在短期内明显上升也很有价值；外周血出现异型淋巴细胞，有助于IM的诊断，但并非特异，必须考虑到其他有关病毒感染
