六淫所伤人体与自然界的气候变化息息相关，特别是胃肠道与外界气候变化的关系则更为密切。六淫之邪侵袭胃肠，经脉气血无以输布，脏腑功能受遏，从而导致各种胃肠病的发生。
外感风邪，可直接侵袭脾胃、肠而致病，可见胃痛、呕吐、不食、泄泻、腹胀、痞满、便血等多种病症。寒邪最易损伤脾胃阳气，阻碍气机，导致脾胃、大小肠的纳化、传导功能失常，而出现脘腹冷痛、恶心呕吐、大便溏泻等症，如消化性溃疡以冬春季节发病率最高。
长夏多雨潮湿，易困脾胃，使脾失健运，胃失和降，升降失职，出现胃脘痞满、不思饮食、四肢困倦、大便溏泻等。秋燥之邪耗伤胃阴；或外感温热之邪入于阳明胃腑，热烁津液，均可出现口燥咽干、饮食减少、大便于结、小便短少等症。古人云“正气存内，邪不可干”，“邪之所凑，其气必虚”。只有在机体正气不足，抵抗力下降的情况下，六淫之邪才能乘虚而人，而见病发于胃肠。
情志失调胃肠病的发生与七情过度密切相关。如长期精神抑郁、忧愁焦虑过度，使脾胃气机不畅，功能紊乱，纳运失常，而出现脘腹痞满，不思饮食，大便泄泻等症。如情绪紧张，肝气郁结，则疏泄失常，或肝气过盛，疏泄太过，横逆乘脾犯胃，脾胃运化失常，则见胸闷善太息，胃脘疼痛痞满，腹痛泄泻等症。肝气犯胃，胃气不降，可致呃逆、呕吐、暖气等症。或暴怒之下，肝气暴张，火动于内，气逆于上'*胃络受伤而致吐血。
现代医学也认为，过度精神刺激，忧郁焦虑等精神因素，使大脑皮质兴奋与抑制过程的平衡失调，自主神经功能紊乱，导致胃壁血管痉挛收缩，胃黏膜缺血，营养不良，日久则发生炎性病变。
