中药种类繁多，名称复杂，这同时代的变迁与地区的差异有关。总的看来，中药的命名多是根据产地、性能、生长特性、形态气味、入药部分及发现者的名字等。
（1）根据药材的产地或集散地命名 如巴豆产四川（古代巴蜀），秦艽产于陕西、甘肃（古代秦国），皆因产地而得名。中药因产地不同，其质量差异很大，为了强调临床用药的佳品，常在中药名前冠以地名，以示优质（道地），如川黄柏、川芎、怀牛膝等。
（2）根据药材形状命名 如钩藤是因为茎枝上有弯曲的钩，故名。
（3）根据药材的颜色命名 丹参因其根皮色紫红、紫草因其色紫、玄参因其色黑而得名。
（4）根据药材的气味命名 五味子因其果皮酸、甜，种子苦、辛又有咸味而取名。苦参因其味极苦，甘草因其味甜，故名。
（5）根据药用植物的生长特性命名 夏枯草因生长到夏至枯萎；款冬花因冬至才开花；半夏指立夏至夏至之间即完成生长周期等。
（6）根据药用部位命名 如桂枝是桂树的嫩枝、鹿角是鹿骨化的角。
（7）根据功效命名 如防风能防治诸风邪、泽泻能渗湿利水肿、远志能益智强志、伸筋草能舒筋通络等。
（8）根据进口药材名的译音命名 如诃子原名“诃黎勒”，产印度、缅甸，音译而来。胡黄连、胡椒均原产印度、尼泊尔等国，其胡字是印度番语之意。
（9）根据人名命名 如何首乌、刘寄奴、杜仲、徐长卿、使君子等都是以纪念最早发现此药的人而得名。
