传统意义上的疑难病和现代医学上的难治病存在很大的相似性，均为症状稀奇古怪，诊断不清，治疗不能奏效，涉及人体各个系统。
疑难病的产生是一个极其复杂因素综合的结果，与患者先天禀赋、后天调养、心理状况、生活环境等都有十分密切的关系。针灸在治疗疑难病方面有一个重要的特点就是辨证与辨病的统一，针灸通过对人体经络的疏通来调整内在病机，通过调节人体阴阳偏盛偏衰，从而达到“阴平阳秘”的状态，恢复其正常的生理功能。针灸通过扶正祛邪、疏通经络，利用不同的穴位，针灸手法操作，对腧穴起到兴奋和抑制的作用，双向调节不同的脏器功能，尤其在一些神经损害中被广泛应用。不仅适用于一些疑难病的急性发作期，还涉及恢复期和后遗症期。
针灸在神经系统疾病方面有突出优势，针灸对于大脑皮质功能的调节影响显著，对于受损伤脊髓功能的恢复更是起到良好的作用。有研究表明，通过电针可以激发失神经支配的肌纤维主动收缩，保持肌细胞固有的舒缩性，促进细胞内新陈代谢，减缓肌蛋白因失神经支配的功能恢复。针灸对于疑难病中急危重症有神效，往往是救急症于顷刻，通过一两个穴位的针刺或放血就能迅速控制症状，缓解病情。
在近几十年的针灸研究和临床实践中发现：针灸既能治疗许多慢性疾患，对一些疑难病与危重症也有广泛的应用。针灸不仅能治疗功能性疾病，同样能治疗器质性病变。疑难病的针灸治疗研究仍倾向于中医辨证论治体系，从整体角度调整机体阴阳、气血、脏腑、经络不平衡的状态，针灸不仅能改善疾病近期症状，而且有效控制复发，改善预后。
在中医学辨证体系中极具特色的经络辨证一直指导着针灸临床，在十四经脉和奇经八脉中，每一条经脉都有一定的循行路线和属络脏腑，当其发生病变时，就会出现本经络的脏腑功能失常的表现，在奇经八脉中还通过与肝、肾、女子胞、脑、髓等关系，在生理和病理方面进行相互影响。在特定穴的选择上也非常重要，十二经脉在四肢肘膝关节以下经络本部各有“井、荥、输、经、合”五个穴位，在《灵枢·顺气一日分为四时》中说：“病在藏者，取之井；病变于色者，取之荥；病时间时神者，取之输；病变于音者，取之经；经满而血者，病在胃，及饮食不节得病者，取之于合”。以及原穴、络穴、郄穴、背俞穴、募穴、下合穴，八会穴、八脉交会穴的随症应用都十分重要。对于疑难病的治疗，针灸治疗总则有以下几方面内容；治病求本；扶正祛邪；急则治标，缓则治本；逆者正治，从者反治；病、症、证同治。
在选穴配伍上，不但要选择常规穴位，还可借鉴西医学知识按神经节段取穴，取距离神经根或神经干临近部位的经穴或非经穴，如胸部疾病可取相应神经节段的夹脊穴，下肢疾病可选择坐骨神经干上的穴来治疗。在进行经络辨证上要注意观察经脉及穴位上的变色、变形、丘疹脱屑等，以及局部压痛点的检查。
针灸为疑难病的治疗提供了宝贵和丰富的理论基础和经验总结，从整体角度把握疾病的内在规律和病机特点，又针对每一个患者制定符合其自身的治疗方法，据证立法，因法施治。针灸在未来治疗疑难病方面一定大有可为，前景广阔。
